cmtk-convertx - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

convertx - تبدیل بین فرمت های فایل تصویری و انواع داده ها.

خلاصه

convertx [گزینه‌ها] فایل درون فایل

شرح

این ابزار بین فرمت های فایل تصویری و انواع داده های پیکسلی تبدیل می کند. همچنین می تواند اعمال شود
عملیات تصویر ساده و همه منظوره در این فرآیند. تعداد دلخواه عملیات
را می توان در خط فرمان مشخص کرد که دقیقاً به ترتیب داده شده اعمال می شود.

OPTIONS

جهانی ابزار گزینه (اینها هستند به اشتراک گذاشته شده by تمام CMTK ابزار)
--کمک
لیستی از گزینه های خط فرمان اصلی را در خروجی استاندارد بنویسید.

--کمک-همه
لیست کاملی از گزینه های خط فرمان اولیه و پیشرفته را در خروجی استاندارد بنویسید.

--ویکی
فهرستی از گزینه های خط فرمان را در خروجی استاندارد در نشانه گذاری مدیاویکی بنویسید.

--مرد
منبع صفحه مرد را در نشانه گذاری 'nroff' در خروجی استاندارد بنویسید.

- نسخه
نسخه جعبه ابزار را در خروجی استاندارد بنویسید.

-- پژواک
خط فرمان فعلی را در خروجی استاندارد بنویسید.

- سطح پرمخاطب
سطح پرحرفی را تنظیم کنید

-- پرحرف, -v
سطح پرحرفی را 1 افزایش دهید (منسوخ شده؛ برای سازگاری با عقب پشتیبانی می شود).

--موضوعات
حداکثر تعداد رشته های موازی (برای رشته های POSIX و OpenMP) را تنظیم کنید.

تصویر/تحول پایگاه داده
--db
مسیری به پایگاه داده تصویر/تغییر که باید با پایگاه داده جدید به روز شود
تصویر [پیش‌فرض: هیچ یک]

ورودی تصویر کنترل
---set-padding
تنظیم مقدار padding: تمام پیکسل های تصویر ورودی که دارای این مقدار هستند نادیده گرفته می شوند
در تمام عملیات های بعدی

-- unset-padding
مقدار padding تنظیم نشده: برای تمام عملیات های بعدی، تمام پیکسل ها درمان می شوند
با توجه به ارزش آنها

--برچسب ها
مشخص کنید که مقادیر تصویر باید به عنوان برچسب های مجزا در نظر گرفته شوند. این نتیجه خواهد شد
در کد هدف مناسب در فایل های خروجی با فرمت NIfTI تنظیم شود.

-- خاکستری
مشخص کنید که مقادیر تصویر به عنوان سطوح خاکستری پیوسته در نظر گرفته شوند. این اراده
کد قصد را در فایل های خوانده شده از فرمت NIfTI بازنشانی کنید.

داده ها نوع تبدیل
-- کاراکتر
8 بیت، عدد صحیح امضا شده

-- بایت
8 بیت، عدد صحیح بدون علامت

--کوتاه
16 بیت، عدد صحیح امضا شده

-- کوتاه
16 بیت، عدد صحیح بدون علامت

--int
عدد صحیح امضا شده 32 بیتی

-- بی قراری
عدد صحیح بدون علامت 32 بیتی

--شناور
ممیز شناور 32 بیتی

--دو برابر
ممیز شناور 64 بیتی

ارزش نگاشت
--map-values
اعمال تابع نگاشت به مقادیر پیکسل. نقشه برداری به صورت تعریف شده است
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]' برای نگاشت مقادیر VAL0، VAL1، و غیره به مقدار جدید NEWVAL. اگر
NEWVAL داده نشده است، مقادیر روی padding تنظیم شده اند.

--map-values-only
تابع نگاشت را روی مقادیر پیکسل اعمال کنید و پیکسل های نگاشت نشده را با padding جایگزین کنید.
چندین چنین قوانین نگاشت را می توان به عنوان RULE0+RULE1[+...] الحاق کرد. همه
قوانین الحاقی به طور همزمان اعمال خواهند شد. نقشه برداری به صورت تعریف شده است
'VAL0[,VAL1,...][:NEWVAL]' برای نگاشت مقادیر VAL0، VAL1، و غیره به مقدار جدید NEWVAL. اگر
NEWVAL داده نشده است، مقادیر روی padding تنظیم شده اند. چندین چنین قوانین نگاشت می تواند باشد
الحاق شده به عنوان RULE0+RULE1[+...]؛ تمام قوانین بهم پیوسته اعمال خواهد شد
با هم.

-- جایگزین کردن-پرده
داده های پیکسلی را با مقدار داده شده جایگزین کنید.

--replace-inf-nan
تمام پیکسل های بی نهایت و بدون عدد را با مقدار داده شده جایگزین کنید.

تصویر کوه در می رم
--flip-x
چرخاندن (آینه) در جهت x

-- flip-y
چرخاندن (آینه) در جهت y

--flip-z
چرخاندن (آینه) در جهت z

تصویر پوشش و آستانه گذاری
-- ماسک
نام فایل ماسک باینری: تمام پیکسل های تصویر را که در آن ماسک 0 است حذف کنید. پیکسل های ماسک شده
روی صفر تنظیم نمی شود، بلکه با بالشتک تنظیم شده فعلی جایگزین می شود
ارزش. از «--set-padding 0» قبل از «--mask» استفاده کنید تا تنظیم را به صفر برسانید.

- معکوس ماسک
نام فایل ماسک باینری معکوس همه پیکسل های تصویر را که در آن ماسک 0 نیست حذف می کند. ببینید
همچنین نکاتی در مورد بالشتک در زیر "--mask" در بالا.

-- thresh-down
همه مقادیر زیر آستانه را روی مقدار آستانه تنظیم کنید.

---بالا
همه مقادیر بالای آستانه را روی مقدار آستانه تنظیم کنید.

-- thresh-below-to-padding
همه مقادیر زیر آستانه را روی مقدار padding تنظیم کنید.

-- thresh-bove-to-padding
همه مقادیر بالای آستانه را روی مقدار padding تنظیم کنید.

-- باینریزه کردن
همه مقادیر زیر آستانه را 0، همه مقادیر برابر یا بالاتر را 1 تنظیم کنید.

--otsu-thresh
با استفاده از آستانه محاسبه شده با روش Otsu، تصویر را به 0/1 تبدیل کنید. استدلال عدد است
سطل های هیستوگرام برای محاسبه آستانه.

--otsu-thresh-nbins
دوتایی سازی با استفاده از روش Otsu با تعداد بن های هیستوگرام تعریف شده توسط کاربر برای
محاسبه آستانه

-- هرس-هیستوگرام
تصویر آستانه با «هرس هیستوگرام شدت»، به عنوان مثال، برای آرگومان داده شده n
[سطل های هیستوگرام] آستانه هایی را تعیین می کنند به طوری که کسر 1/n-ام بالاترین و
پایین ترین وکسل ها آستانه هستند.

-- هرس-هیستوگرام-بالا
مانند '--Pune-Histograms'، اما فقط شدت های بالا را حذف کنید.

-- هرس-هیستوگرام-کم
مانند '--Pune-Histograms'، اما فقط شدت های کم را حذف کنید.

شدت تحول
-- مقیاس به محدوده
قبل از تبدیل به بایت، شدت تصویر را در محدوده «از: به»، به عنوان مثال، «0:255» مقیاس کنید
داده است.

--هیستوگرام-تعادل
یکسان سازی هیستوگرام را اعمال کنید.

--histogram-equalization-nbins
تساوی هیستوگرام را با تعداد سطل ها

--Match-Histograms
شدت ها را برای مطابقت با توزیع در تصویر ارائه شده به عنوان آرگومان تبدیل کنید
برای این دستور

--match-mean-sdev
شدت مقیاس را برای مطابقت با میانگین و توزیع استاندارد شدت ها در
تصویر به عنوان آرگومان این دستور ارائه شده است.

مورفولوژیکی عملیات
-- برگرداندن
یک ماسک باینری را برگردانید، به عنوان مثال، پیش زمینه و پس زمینه را مبادله کنید.

-- فرسایش
عملگر فرسایش مورفولوژیکی (بر اساس پیکسل)

-- گشاد کردن
عملگر اتساع مورفولوژیکی (بر حسب پیکسل)

-- فرسایش-فاصله
عملگر فرسایش مورفولوژیکی (بر اساس فاصله). اغلب برای داده های ناهمسانگرد ترجیح داده می شود.

-- فرسایش-فاصله-چند برچسب
عملگر فرسایش مورفولوژیکی (بر اساس فاصله) برای نقشه های چند برچسبی. نتیجه خواهد شد
بسته به ایندکس بایت، داده های کوتاه بدون علامت یا int بدون علامت
بزرگترین برچسب استفاده شده در ورودی

-- dilate-distance
اپراتور اتساع مورفولوژیکی (بر اساس فاصله). اغلب برای ناهمسانگرد ترجیح داده می شود
داده است.

- اجزای متصل
نقشه اجزای متصل را با مناطق شماره گذاری شده با کاهش اندازه مؤلفه ایجاد کنید

---نقشه مرزی
ایجاد نقشه مرزی

--نقشه چند مرزی
ایجاد نقشه مرزی چند ارزشی

- نقشه فاصله
نقشه فاصله اقلیدسی بدون علامت را محاسبه کنید. تصویر ورودی به عنوان ماسک باینری تفسیر می شود.

- نقشه فاصله امضا شده
نقشه فاصله اقلیدسی امضا شده (داخل=منفی، بیرون=مثبت) را محاسبه کنید

فیلتر عملیات
---میانگین-فیلتر
فیلتر میانه این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل به عنوان پارامتر در نظر می گیرد. آ
یک عدد صحیح شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند. سه کاما-
اعداد صحیح جدا شده شعاع جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

----فیلتر
فیلتر میانگین منطقه ای این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل می گیرد
پارامتر. یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند. سه
اعداد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

---fast-mean-filter
فیلتر میانگین منطقه ای (اجرای زمانی سریع و خطی). این عملیات طول می کشد
شعاع فیلتر بر حسب پیکسل به عنوان پارامتر. یک عدد صحیح تنها شعاع هسته را مشخص می کند
در هر سه بعد سه عدد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای آن تعریف می کنند
سه بعدی

واریانس-فیلتر
فیلتر واریانس منطقه ای این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل می گیرد
پارامتر. یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند. سه
اعداد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

---فیلتر واریانس سریع
فیلتر واریانس منطقه ای سریع (زمان خطی). این عملیات شعاع فیلتر را می گیرد
در پیکسل به عنوان پارامتر. یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه تعریف می کند
ابعاد سه عدد صحیح جدا شده با کاما شعاع جداگانه ای را برای این سه تعریف می کنند
ابعاد

---فیلتر لحظه سوم
فیلتر لحظه سوم منطقه ای. این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل می گیرد
پارامتر. یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند. سه
اعداد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

---استاندارد-انحراف-فیلتر
فیلتر انحراف استاندارد منطقه ای این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل می گیرد
به عنوان پارامتر یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند.
سه عدد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

- صافی-فیلتر
فیلتر منطقه ای "صافی". این عملیات شعاع فیلتر را بر حسب پیکسل می گیرد
پارامتر. یک عدد صحیح واحد شعاع هسته را در هر سه بعد مشخص می کند. سه
اعداد صحیح جدا شده با کاما شعاع های جداگانه ای را برای سه بعد تعریف می کنند.

گاوسی-فیلتر-سیگما
تصویر را با هسته گاوسی فیلتر کنید. این عملیات یک مقدار واقعی می گیرد
پارامتر، که سیگما ضریب هسته را در واحدهای جهانی [به عنوان مثال، میلی متر] مشخص می کند.
پارامتر

-- گاوسی-فیلتر-fwhm
تصویر را با هسته گاوسی فیلتر کنید. این عملیات یک مقدار واقعی می گیرد
پارامتر، که عرض کامل هسته را در نصف حداکثر در واحدهای جهانی مشخص می کند
[به عنوان مثال، میلی متر].

--laplace-filter
تصویر را با هسته لاپلاسی تقویت‌کننده لبه فیلتر کنید.

توری عملیات
--downsample-انتخاب کنید
نمونه برداری تصویر با انتخاب پیکسل با استفاده از فاکتورهای هر محور 'Fx, Fy, Fz' یا با استفاده از تک
فاکتور "Fxyz"

--downsample-Average
با میانگین‌گیری با استفاده از فاکتورهای هر محور «Fx، Fy، Fz» یا استفاده از یک تصویر پایین‌نمونه
فاکتور "Fxyz"

-- نمونه مجدد
با حفظ میدان دید تصویر، تصویر را به پیکسل های نزدیک به همسانگرد نمونه برداری کنید.
یک آرگومان می گیرد، وضوح هدف در واحدهای جهانی [به عنوان مثال، میلی متر]

--نمونه مجدد-دقیق
تصویر را مجدداً به پیکسل های همسانگرد با وضوح داده شده در حالی که مطابقت دارد، دوباره نمونه بگیرید
میدان دید تصویر تا حد امکان نزدیکتر باشد. یک آرگومان می گیرد، وضوح هدف
در واحدهای جهانی [به عنوان مثال، میلی متر]

-- برش به شاخص
برش تصویر به یک منطقه مشخص شده توسط مجموعه ای از شش مختصات شاخص شبکه ای که به صورت مشخص شده است
comma-separated integers x0,y0,z0,x1,y1,z1

-- محصول به آستانه
برش تصویر به منطقه تعیین شده از طریق یک آستانه مشخص. تصویر حاصل خواهد شد
شامل تمام پیکسل های بزرگتر از پارامتر داده شده است.

-منطقه-برش-به-آستانه-نوشتن
برش تصویر به منطقه تعیین شده از طریق یک آستانه مشخص و نوشتن منطقه برش در
خروجی استاندارد

--crop-by-threshold-write-xform
برش تصویر به منطقه تعیین شده از طریق یک آستانه مشخص و نوشتن برش
تبدیل به خروجی استاندارد

AUTHORS

تورستن روهلفینگ، با مشارکت مایکل پی. هاسک، گرگ جفریس، کالوین آر.
مورر، دانیل بی. روساکوف، و یاروسلاو هالچنکو

از cmtk-convertx به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید