این دستور delta2block است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
delta2blocks - ابزاری اضافی برای مومر از تکه های ماگسی تا مرتب کردن ترازها
delta2maf - ابزاری اضافی برای مومر از تکه های ماگسی تا مرتب کردن ردیف ها
خلاصه
delta2blocks [گزینه ها]<مراجعهشناسه ><qryشناسه >
delta2maf [گزینه ها]<مراجعهشناسه ><qryشناسه >
شرح
-h نمایش اطلاعات راهنما
-q ترازها را بر اساس مختصات شروع پرس و جو مرتب کنید
-r ترازها را بر اساس مختصات شروع مرجع مرتب کنید
-w int عرض صفحه را تنظیم کنید - پیش فرض 60 است
-x int نوع ماتریس را تنظیم کنید - پیش فرض 2 است (BLOSUM 62)، گزینه های دیگر شامل 1 (BLOSUM 45) است.
و 3 (BLOSUM 80)
توجه: فقط روی تراز اسیدهای آمینه تأثیر دارد
ورودی خروجی دلتای برنامه "nucmer" یا "promer" است که بر روی
خط فرمان.
خروجی stdout است و شامل تمام همترازی‌های بین پرس و جو و مرجع است
توالی های شناسایی شده در خط فرمان
توجه: هیچ مرتب‌سازی به‌طور پیش‌فرض انجام نمی‌شود، بنابراین هم‌ترازی‌ها به‌صورتی که در آن یافت می‌شود مرتب می‌شوند
را ورودی
از delta2block به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
