این دستور fpromle است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
fproml - فیلوژنی پروتئین با حداکثر احتمال
خلاصه
fproml -توالی seqsetall -intreefile درخت [- دسته بندی ها عدد صحیح] -نرخ صف
-دسته بندی ها املاک [-وزن املاک] -طول بولی [-مدل فهرست]
[-گاما فهرست] -ضریب گاما شناور -ngammacat عدد صحیح ضریب نامتغیر شناور
-ninvarcat عدد صحیح -invarfrac شناور -nhmmcategories عدد صحیح هممریتز صف
-احتمالات صف -adjsite بولی -لامبدا شناور -بهم ریخته عدد صحیح
-بذر عدد صحیح -جهانی بولی [-outgrno عدد صحیح] [از طریق بولی] -outfile مجموعه
[-ماهی قزل آلا تغییر وضعیت] -Outtreefile مجموعه [-داده های چاپی بولی] [-پیش رفتن بولی]
[-اثر درخت بولی] [هیپستات بولی]
fproml -کمک
شرح
fproml یک برنامه خط فرمان از EMBOSS ("European Molecular Biology Open
بسته نرم افزاری"). این بخشی از گروه(های) فرمان "Phylogeny:Molecular Sequence" است.
OPTIONS
ورودی بخش
-توالی seqsetall
فایل حاوی یک یا چند تراز توالی
-intreefile درخت
- دسته بندی ها عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 1
-نرخ صف
-دسته بندی ها املاک
-وزن املاک
فایل وزن
اضافی بخش
-طول بولی
مقدار پیش فرض: N
-مدل فهرست
مقدار پیش فرض: Jones-Taylor-Thornton
-گاما فهرست
مقدار پیش فرض: نرخ ثابت
-ضریب گاما شناور
مقدار پیش فرض: 1
-ngammacat عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 1
ضریب نامتغیر شناور
مقدار پیش فرض: 1
-ninvarcat عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 1
-invarfrac شناور
مقدار پیش فرض: 0.0
-nhmmcategories عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 1
هممریتز صف
مقدار پیش فرض: 1.0
-احتمالات صف
مقدار پیش فرض: 1.0
-adjsite بولی
مقدار پیش فرض: N
-لامبدا شناور
مقدار پیش فرض: 1.0
-بهم ریخته عدد صحیح
-بذر عدد صحیح
مقدار پیش فرض: 1
-جهانی بولی
مقدار پیش فرض: N
-outgrno عدد صحیح
از طریق بولی
مقدار پیش فرض: Y
تولید بخش
-outfile مجموعه
-ماهی قزل آلا تغییر وضعیت
مقدار پیش فرض: Y
-Outtreefile مجموعه
-داده های چاپی بولی
مقدار پیش فرض: N
-پیش رفتن بولی
مقدار پیش فرض: Y
-اثر درخت بولی
مقدار پیش فرض: Y
هیپستات بولی
مقدار پیش فرض: N
با استفاده از خدمات onworks.net از fpromle به صورت آنلاین استفاده کنید
