این دستور gmx-saltbr است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gmx-saltbr - محاسبه پل نمک
خلاصه
gmx saltbr [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr>]] [-b ] [-e ]
[-dt ] [-t ] [- [نه] سپتامبر]
شرح
gmx saltbr فاصله بین همه ترکیبی از گروه های باردار را به عنوان تابعی از
زمان. گروه ها به روش های مختلف ترکیب می شوند. حداقل فاصله می تواند داده شود (یعنی الف
قطع)، به طوری که گروه هایی که هرگز از آن فاصله نزدیکتر نیستند، رسم نمی شوند.
خروجی در تعدادی نام فایل ثابت خواهد بود، min-min.xvg, plus-min.xvg و
plus-plus.xvg، یا برای هر جفت یون جداگانه اگر -سپتامبر گزینه انتخاب شده است. که در
در این مورد، فایل ها به عنوان نامگذاری می شوند sb-(Resname)(Resnr)-(Atomnr). ممکن است وجود داشته باشد بسیاری چنین فایل هایی
OPTIONS
گزینه هایی برای تعیین فایل های ورودی:
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
مسیر حرکت: xtc TRR cpt غروب g96 پی دی بی tng
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
فایل ورودی xdr run قابل حمل
گزینه های دیگر:
-b (0)
اولین فریم (ps) برای خواندن از مسیر
-e (0)
آخرین فریم (ps) برای خواندن از مسیر
-dt (0)
فقط زمانی از قاب استفاده کنید که t MOD dt = اولین بار (ps)
-t (1000)
گروه هایی که هرگز از این فاصله نزدیکتر نیستند رسم نمی شوند
- [نه] سپتامبر (نه)
برای هر تعامل از فایل های جداگانه استفاده کنید (ممکن است تعداد زیادی باشد)
با استفاده از خدمات onworks.net از gmx-saltbr به صورت آنلاین استفاده کنید
