این دستور gt-readjoiner-assembly است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gt-readjoiner-assembly - گراف رشته ای بسازید و کانتیگ های خروجی.
خلاصه
gt ادغام کننده مجلس [گزینه ...]
شرح
- تنظیم مجدد [رشته]
نام مجموعه خواندنی را مشخص کنید (پیش‌فرض: تعریف نشده)
-فایل های spm [ارزش]
تعداد فایل های SPM برای خواندن این باید با مقدار -j برای همپوشانی برابر باشد
فاز (پیش‌فرض: 1)
-l [ارزش]
حداقل طول SPM را مشخص کنید (پیش‌فرض: 0)
قطع عمق [ارزش]
حداقل تعداد گره ها را در یک contig مشخص کنید (پیش فرض: 3)
-قطع طول [ارزش]
حداقل طول یک contig را مشخص کنید (پیش‌فرض: 100)
-خطاها [بله | نه]
ویژگی های نمودار را که ممکن است از خطاهای توالی یابی نشات گرفته اند را جستجو کنید و آنها را حذف کنید
(پیش فرض: خیر)
-حباب [ارزش]
تعداد دور حذف حباب p برای انجام (پیش‌فرض: 3)
-بن بست [ارزش]
تعداد دور حذف بن بست برای انجام یک بن بست (پیش فرض: 10)
-بن بست-عمق [ارزش]
حداکثر عمق یک مسیر را به یک راس انتهایی که مسیر باید بر اساس آن باشد را مشخص کنید
بن بست در نظر گرفته می شود (پیش فرض: 10)
-v [بله | نه]
پرحرف باشد (پیش‌فرض: خیر)
-q [بله | نه]
سرکوب پیام‌های خروجی استاندارد (پیش‌فرض: خیر)
-کمک
نمایش راهنما برای گزینه های اساسی و خروج
-help+
نمایش راهنما برای همه گزینه ها و خروج
-version
نمایش اطلاعات نسخه و خروج
گزارش نویسی اشکالات
گزارش اشکالات به[ایمیل محافظت شده]>.
از gt-readjoiner-assembly به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
