این دستور maskseqe است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
maskseq - دنباله ای با مناطق پوشانده بنویسید
خلاصه
maskseq -توالی دنباله -مناطق محدوده [-برای کاهش تغییر وضعیت] -ماسکچار رشته
-بیرون دنباله رو
maskseq -کمک
شرح
maskseq یک برنامه خط فرمان از EMBOSS ("European Molecular Biology Open
بسته نرم افزاری"). این بخشی از گروه(های) فرمان "ویرایش" است.
OPTIONS
ورودی بخش
-توالی دنباله
ضروری بخش
-مناطق محدوده
مناطق برای پوشاندن. مجموعه ای از مناطق با مجموعه ای از جفت موقعیت ها مشخص می شود. در
موقعیت ها اعداد صحیح هستند آنها با هر کاراکتر غیر رقمی و غیر آلفا از هم جدا می شوند.
نمونه هایی از مشخصات منطقه عبارتند از: 24-45، 56-78 1:45، 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
اضافی بخش
-برای کاهش تغییر وضعیت
منطقه را می توان با تبدیل کاراکترهای دنباله به حروف کوچک، برخی، "ماسک" کرد
برنامه های غیر EMBOSS به عنوان مثال fasta می توانند این را به عنوان یک منطقه ماسک دار تفسیر کنند. دنباله این است
بدون تغییر به غیر از تغییر مورد. ممکن است دوست داشته باشید که تمام دنباله را تضمین کنید
قبل از پوشاندن مناطق مشخص شده به حروف کوچک با استفاده از حروف بزرگ است
پرچم "شام" مقدار پیش فرض: N
-ماسکچار رشته
کاراکتری برای استفاده در هنگام ماسک کردن. پیش‌فرض برای توالی‌های پروتئین «X»، برای نوکلئیک «N» است
دنباله ها اگر کاراکتر ماسک به صورت کاراکتر SPACE یا نویسه تهی تنظیم شده باشد،
سپس توالی با تغییر آن به حروف کوچک «ماسک» می‌شود، درست مانند مورد
پرچم "-کوچک". مقدار پیش‌فرض: @($(acdprotein)?X:N)
تولید بخش
-بیرون دنباله رو
از maskseqe به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
