mia-3dmotioncompica-nonrigid - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

mia-3dmotioncompica-nonrigid - ثبت غیر خطی مجموعه ای از تصاویر سه بعدی.

خلاصه

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [گزینه ها]

شرح

mia-3dmotioncompica-nonrigid این برنامه یک نسخه سه بعدی از حرکت را پیاده سازی می کند
الگوریتم جبران توضیح داده شده در Wollny G، Kellman P، Santos A، Ledesma-Carbayo MJ،
" جبران حرکت خودکار تنفس آزاد داده های پرفیوژن میوکارد توسط
با استفاده از تجزیه و تحلیل مؤلفه های مستقل»، تجزیه و تحلیل تصویر پزشکی، 2012،
DOI: 10.1016/j.media.2012.02.004.

OPTIONS

فایل-IO
-i --in-file=(ورودی، مورد نیاز); io
تصاویر ورودی فایل های شماره گذاری شده متوالی (nameXXXX.ext) برای پشتیبانی
انواع فایل PLUGINS:3dimage/io را ببینید

-o --out-file=(خروجی، مورد نیاز); io
نام تصویر خروجی (به عنوان رشته فرمت C شامل %04d به منظور تعریف
شماره گذاری فایل) برای انواع فایل های پشتیبانی شده PLUGINS:3dimage/io را ببینید

--save-refs=
ذخیره تصاویر مرجع، رشته داده شده به عنوان پایه نام فایل استفاده می شود
الگوی عددی از تصاویر ورودی پیروی می کند و فرمت خروجی همیشه است
"چشم انداز"

--save-regs=
تصاویر ثبت شده متوسط ​​را ذخیره کنید، رشته داده شده به عنوان نام فایل استفاده می شود
پایه، الگوی اعداد از تصاویر ورودی پیروی می کند و فرمت خروجی آن است
همیشه "ویستا"

--save-coeffs=
ماتریس میکس را در یک فایل متنی ذخیره کنید

--save-features=
تصاویر ویژگی را به صورت PNG ذخیره کنید

کمک & اطلاعات
-V --verbose=اخطار
پرحرفی خروجی، چاپ پیام های سطح معین و اولویت های بالاتر.
اولویت های پشتیبانی شده که از پایین ترین سطح شروع می شوند عبارتند از:
اطلاعات - پیام های سطح پایین
رد - ردیابی فراخوانی تابع
شکست خوردن - گزارش شکست تست
هشدار - هشدارها
خطا - گزارش خطاها
اشکال زدایی کردن - خروجی اشکال زدایی
پیام - پیام های عادی
کشنده - فقط خطاهای مرگبار را گزارش دهید

--کپی رایت
چاپ اطلاعات حق چاپ

-h -- کمک
چاپ این راهنما

-؟ --استفاده
یک راهنما کوتاه چاپ کنید

- نسخه
شماره نسخه را چاپ کنید و خارج شوید

ICA
-C --components=0
اجزای ICA 0 = برآورد خودکار اجزای ICA 0 = خودکار
برآورد کردن

-- بدون عادی سازی
آی سی ها را عادی نکنید

--بدون معنی
میانگین را از منحنی های اختلاط حذف نکنید

-k --skip=0
از تصاویر در ابتدای مجموعه بگذرید، به عنوان مثال، به این دلیل که تصاویر دیگر هستند
روش‌ها از تصاویر در ابتدای مجموعه صرفنظر کنید، به عنوان مثال، زیرا آنها
از سایر روش ها هستند

-m --max-ica-iter=400
حداکثر تعداد تکرار در ICA حداکثر تعداد تکرار در ICA

پردازش
--threads=-1
حداکثر تعداد نخ هایی که برای پردازش استفاده می شود، این تعداد باید کمتر باشد
یا برابر با تعداد هسته های پردازشگر منطقی در دستگاه است. (-1:
تخمین خودکار).حداکثر تعداد رشته ها برای استفاده برای پردازش،این
تعداد باید کمتر یا برابر با تعداد هسته های پردازشگر منطقی موجود باشد
ماشین. (-1: برآورد خودکار).

ثبت
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
بهینه ساز برای کمینه سازی استفاده می شود

-a --start-c-rate=32
نرخ ضریب شروع در خارها، تقسیم بر --c-rate-divider با
هر نرخ ضریب شروع عبور در خارها بر --c-rate-divider تقسیم می شود
با هر پاس

--c-rate-divider=4
تقسیم کننده نرخ ضریب برای هر پاس تقسیم کننده نرخ ضریب برای هر پاس

-d --start-divcurl=20
وزن divcurl را شروع کنید، با هر پاس شروع به --divcurl-divider تقسیم می شود
وزن divcurl، با هر پاس بر --divcurl-divider تقسیم می شود

--divcurl-divider=4
مقیاس بندی وزن divcurl با هر وزنه برداری جدید passdivcurl با هر یک
پاس جدید

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
هزینه تصویر

-l --mg-levels=3
سطوح چند رزولوشن سطوح چند تفکیک پذیر

-P --passes=3
گذرنامه های ثبت نام مجوزهای ثبت نام

پلاگین ها: 3dimage/io

تحلیل آنالیز تصویر 7.5

پسوندهای فایل شناسایی شده: .HDR، .hdr

انواع عناصر پشتیبانی شده:
بدون علامت 8 بیتی، امضا شده 16 بیتی، امضا شده 32 بیتی، ممیز شناور 32 بیتی،
ممیز شناور 64 بیتی

مخزن داده IO مجازی به و از مخزن داده داخلی

پسوندهای فایل شناسایی شده: .@

دیکام سری تصاویر Dicom به صورت سه بعدی

پسوندهای فایل شناسایی شده: .DCM، .dcm

انواع عناصر پشتیبانی شده:
امضا 16 بیت بدون امضا 16 بیت

hdf5 HDF5 تصویر سه بعدی IO

پسوندهای فایل شناسایی شده: .H5، .h5

انواع عناصر پشتیبانی شده:
داده های باینری، 8 بیتی بدون علامت، 8 بیتی بدون علامت، 16 بیتی امضا شده، 16 بیتی بدون علامت،
امضا 32 بیت بدون امضا 32 بیت امضا 64 بیت بدون امضا 64 بیت شناور
نقطه 32 بیت، ممیز شناور 64 بیت

اینریا تصویر INRIA

پسوندهای فایل شناسایی شده: INR، .inr

انواع عناصر پشتیبانی شده:
امضا شده 8 بیت، بدون امضا 8 بیت، امضا 16 بیت، بدون امضا 16 بیت، امضا شده 32
بیت، بدون علامت 32 بیت، ممیز شناور 32 بیت، ممیز شناور 64 بیت

مرداد IO تصویر سه بعدی MetaIO با استفاده از اجرای VTK (تجربی).

پسوندهای فایل شناسایی شده: MHA، .MHD، .mha، .mhd

انواع عناصر پشتیبانی شده:
امضا شده 8 بیت، بدون امضا 8 بیت، امضا 16 بیت، بدون امضا 16 بیت، امضا شده 32
بیت، بدون علامت 32 بیت، ممیز شناور 32 بیت، ممیز شناور 64 بیت

نیفتی IO تصویر سه بعدی NIFTI-1

پسوندهای فایل شناسایی شده: NII، .nii

انواع عناصر پشتیبانی شده:
امضا شده 8 بیت، بدون امضا 8 بیت، امضا 16 بیت، بدون امضا 16 بیت، امضا شده 32
بیت، بدون علامت 32 بیت، امضا 64 بیت، بدون علامت 64 بیت، ممیز شناور 32
بیت، ممیز شناور 64 بیتی

vff فرمت شطرنجی VFF Sun

پسوندهای فایل شناسایی شده: .VFF، .vff

انواع عناصر پشتیبانی شده:
بدون علامت 8 بیتی، امضا شده 16 بیتی

چشم انداز نمای سه بعدی

پسوندهای فایل شناسایی شده: .V، .VISTA، .v، .vista

انواع عناصر پشتیبانی شده:
داده های باینری، 8 بیتی بدون علامت، 8 بیتی بدون علامت، 16 بیتی امضا شده، 16 بیتی بدون علامت،
امضا شده 32 بیت، بدون علامت 32 بیت، ممیز شناور 32 بیت، ممیز شناور 64
ذره

vti تصویر سه بعدی VTK-XML ورودی و خروجی (تجربی).

پسوندهای فایل شناسایی شده: .VTI، .vti

انواع عناصر پشتیبانی شده:
امضا شده 8 بیت، بدون امضا 8 بیت، امضا 16 بیت، بدون امضا 16 بیت، امضا شده 32
بیت، بدون علامت 32 بیت، ممیز شناور 32 بیت، ممیز شناور 64 بیت

vtk تصویر سه بعدی VTK میراث ورودی و خروجی (تجربی).

پسوندهای فایل شناسایی شده: .VTK، .VTKIMAGE، .vtk، .vtkimage.

انواع عناصر پشتیبانی شده:
داده های باینری، 8 بیتی بدون علامت، 8 بیتی بدون علامت، 16 بیتی امضا شده، 16 بیتی بدون علامت،
امضا شده 32 بیت، بدون علامت 32 بیت، ممیز شناور 32 بیت، ممیز شناور 64
ذره

مثال

سری پرفیوژن ارائه شده در imagesXXXX.v را با استفاده از ICA کلاس 4 ثبت کنید
برآورد کردن. از دو تصویر در ابتدا رد شوید، حداکثر از 4 موضوع ثبت نام، یک nlopt استفاده کنید
بهینه ساز مبتنی بر و در غیر این صورت از پارامترهای پیش فرض استفاده می کنند. نتیجه را در
ثبت شدهXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonRigid -i images0000.v -o registered%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

نویسنده(های)

گرت وولنی

کپی رایت

این نرم افزار دارای حق چاپ (c) 1999-2015 لایپزیگ، آلمان و مادرید، اسپانیا است. می آید
بدون ضمانت مطلق و شما می توانید آن را تحت شرایط گنو توزیع کنید
GENERAL PUBLIC LICENSE نسخه 3 (یا جدیدتر). برای اطلاعات بیشتر برنامه را با
گزینه "--کپی رایت".

با استفاده از خدمات onworks.net از mia-3dmotioncompica-nonrigid به صورت آنلاین استفاده کنید