این فرمان STAR است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
STAR - تراز کننده فوق سریع جهانی RNA-seq
شرح
Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR) نرم افزار بر اساس قبلی
الگوریتم تراز RNA-seq توصیف نشده که از جستجوی بذر حداکثر قابل نقشه برداری متوالی استفاده می کند
در آرایه های پسوندی فشرده نشده و پس از خوشه بندی دانه ها و روش دوخت. ستاره
با ضریب بیش از 50 در سرعت نقشه برداری از دیگر هم ترازها بهتر عمل می کند و با انسان هم تراز می شود
ژنوم 550 میلیون 2 × 76 جفت بر ثانیه خواندن جفت پایان در ساعت بر روی یک سرور متوسط 12 هسته ای، در حالی که
در عین حال حساسیت و دقت تراز را بهبود می بخشد. علاوه بر بی طرفی د
تشخیص novo اتصالات متعارف، STAR می تواند اتصالات غیر متعارف و
رونوشت های کایمریک (همجوشی) و همچنین قادر به ترسیم توالی های RNA تمام قد است.
با استفاده از توالی یابی Roche 454 آمپلیکون های واکنش زنجیره ای پلیمراز رونویسی معکوس،
نویسندگان به طور تجربی اتصالات پیوند بین ژنی جدید 1960 را با 80-90٪ تأیید کردند.
میزان موفقیت، که دقت بالای استراتژی نقشه برداری STAR را تایید می کند.
خلاصه
STAR --option1-name option1-value(s)--option2-name گزینه2-مقدار(های) ...
از STAR آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
