این برنامه لینوکس به نام BayesRate برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان BayesRate1.65.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام BayesRate را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
BayesRate برای اجرای آنلاین در لینوکس
Ad
شرح
BayesRate برنامه ای برای تخمین گونه زایی و نرخ انقراض از فیلوژنی های تاریخ دار در چارچوب بیزی است.روش ها در شرح زیر است:
Silvestro, D., Schnitzler, J. and Zizka, G. (2011) یک چارچوب بیزی برای تخمین نرخ های تنوع و تغییرات آنها در زمان و مکان. BMC Evolutionary Biology، 11، 311
Silvestro D., Zizka G. & Schulte K. (2014) تفکیک اثرات نوآوری های کلیدی در تنوع Bromelioideae (Bromeliaceae). تکامل، 68، 163-175.
امکانات
- از آنجایی که نسخه 1.64 BayesRate به Dendropy نسخه 4 نیاز دارد (نسخه 3 دیگر پشتیبانی نمی شود)
- از نسخه 1.3، کتابخانه پایتون DendroPy به جای rpy2 مورد نیاز است
- BiSSE-BMA از نسخه 1.5 اضافه شده است (Silvestro et al. 2013; DOI: 10.1111/evo.12236)
زبان برنامه نویسی
پایتون، S/R
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/bayesrate/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
