این برنامه لینوکس به نام CAMPARI برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام campari_v3_09052017.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام CAMPARI را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
CAMPARI به صورت آنلاین در لینوکس اجرا می شود
Ad
شرح
مفتخریم نسخه 3 کامپاری را معرفی کنیم. این یک گام بزرگ نسبت به نسخه 2 است که عمدتاً به دلیل پشتیبانی جامع OpenMP (موازی رشته ها) و به دلیل پیشرفت های قابل توجه در قابلیت استفاده و عملکرد است. ما همچنین تعدادی الگوریتم جدید را از ادبیات اخیر اضافه کرده‌ایم، و CAMPARI البته به پشتیبانی از پارادایم میدان نیروی ABSINTH و مدل حل‌یابی ضمنی ادامه می‌دهد.CAMPARI یک بسته مشترک برای انجام و تجزیه و تحلیل شبیه سازی های مولکولی، به ویژه پلیمرهای مرتبط با بیولوژیکی است. این بر روی در دسترس بودن گسترده الگوریتم‌ها برای نمونه‌برداری (پیشرفته) تمرکز می‌کند و می‌تواند مونت کارلو و نمونه‌برداری دینامیک مولکولی را به صورت یکپارچه ترکیب کند. CAMPARI سطح بسیار بالایی از کنترل را بر تمامی ویژگی های پیاده سازی شده به کاربر ارائه می دهد. برای اطلاعات بیشتر و ویژگی ها، لطفا به صفحه اصلی پروژه در http://campari.sourceforge.net. نسخه 2 دیگر به طور فعال نگهداری نمی شود اما نسخه نهایی همچنان در دسترس است.
امکانات
- نمونه برداری ترکیبی MC و MD، MD در فضای دکارتی یا پیچشی / جسم صلب
- موازی سازی کارآمد OpenMP تمام روال های انرژی/نیروی اصلی
- تجزیه و تحلیل در حین پرواز یا اجرا به عنوان ابزار تحلیل مسیر (همچنین به صورت موازی)
- بسیاری از روال های تحلیل داخلی (DSSP، نقشه های تماس، توابع همبستگی جفت و غیره)
- پشتیبانی از چندین خوشه بندی ساختاری و الگوریتم های مرتبط با آنالیز مدل حالت مارکوف
- کاملا مستند (html) و علاوه بر آن با 13 آموزش ارسال شده است
- سطح کنترل بسیار بالا (به عنوان مثال، محدودیت های هولونومی سفارشی در MD)
- پشتیبانی گسترده از تکنیک های شبیه سازی چند کپی موازی مانند تبادل ماکت در اجرای موازی MPI/OpenMP ترکیبی
- تسهیلات تجزیه و تحلیل مستقل برای امکانات مدل حالت خوشه‌بندی/مارکوف
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول / ترمینال
زبان برنامه نویسی
فورتان
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/campari/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
