این برنامه لینوکس با نام CSBB-v3.0 است که آخرین نسخه آن را می توان با نام CSBB-v3.0.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام CSBB-v3.0 را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
CSBB-v3.0
Ad
شرح
CSBB یک مجموعه بیوانفورماتیک مبتنی بر خط فرمان برای تجزیه و تحلیل داده‌های بیولوژیکی به‌دست‌آمده از راه‌های مختلف آزمایش‌های بیولوژیکی است. CSBB در پرل پیاده‌سازی شده است، در حالی که از R، java، python و ruby در پس‌زمینه برای ماژول‌های خاص نیز استفاده می‌کند. تمرکز اصلی CSBB این است که به کاربرانی از جامعه زیست شناسی و بیوانفورماتیک اجازه دهد تا با انجام وظایف تجزیه و تحلیل پایین دستی و در عین حال حذف نیاز به نوشتن کد برنامه نویسی، از آنها بهره مند شوند. CSBB در حال حاضر در لینوکس، یونیکس در دسترس است.در حال حاضر CSBB 18 ماژول را ارائه می دهد که بر روی وظایف تحلیلی مانند انجام عادی سازی چندک بالایی، تجسم تعاملی و خطوط لوله توالی نسل بعدی متمرکز شده اند. CSBB اکنون همچنین توانایی پردازش داده های عمومی را دارد. ارائه تجربه خط لوله End to End به کاربر.
امکانات
- RNA-Seq
- ChiP-Seq
- ATAC-Seq
- عادی سازی
- بیان دیفرانسیل
- پردازش داده های عمومی
- خطوط لوله انتهایی
- متن باز
- تجسم
- بیوانفورماتیک
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پرل
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
