این برنامه لینوکس با نام CUSHAW3: Accurate Short-Read Alignment برای اجرا در لینوکس آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام cushaw3-v3.0.3.tar.bz2 دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه را با نام CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا در لینوکس بصورت آنلاین با OnWorks به صورت رایگان اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
CUSHAW3: تراز خواندن کوتاه دقیق برای اجرای آنلاین در لینوکس
Ad
شرح
CUSHAW3 یک ردیف‌کننده موازی، حساس و دقیق متن‌باز است. این هم‌سطح یک رویکرد کلی برای تراز کردن مناسب خواندن آسان و سخت با ژنوم‌های بزرگ مانند ژنوم انسان پیشنهاد می‌کند. ارزیابی را روی واقعی‌های کیفیت هم‌ترازی انجام دهید که CUSHAW3 به طور مداوم از CUSHAW2، BWA-MEM، Bowtie2 و GEM از نظر تراز تک‌انتهی و جفتی بهتر عمل می‌کند. علاوه بر این، aligner ما عملکرد تراز زوجی بهتری نسبت به Novalign3 برای خواندن های کوتاه با نرخ خطای بالا نشان داده است.رابط کاربری
کنسول / ترمینال
زبان برنامه نویسی
++C
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/cushaw3/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
