This is the Linux app named Data Analysis for the Life Sciences whose latest release can be downloaded as labssourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
این برنامه با نام «تحلیل داده‌ها برای علوم زیستی با OnWorks» را به صورت رایگان دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
تحلیل داده‌ها برای علوم زیستی
شرح
این مخزن، فایل‌های منبع R Markdown (.Rmd) را برای مجموعه دوره‌های PH525x / HarvardX (تحلیل داده‌ها برای علوم زیستی / ژنومیک) که توسط GenomicsClass مدیریت می‌شود، در خود جای داده است. این مخزن به عنوان منبع اصلی برای تمرین‌های آزمایشگاهی دوره، ماژول‌های سخنرانی و مطالب خواندنی در قالبی قابل تکرار عمل می‌کند. دانشجویان و زبان‌آموزان از این فایل‌های R Markdown برای دنبال کردن، ایجاد دفترچه یادداشت، اجرای نمونه‌های کد و تکمیل تکالیف مبتنی بر آزمایشگاه استفاده می‌کنند. این مخزن تحت لیسانس MIT است و امکان استفاده مجدد و اصلاح را فراهم می‌کند. این مخزن بخشی از یک اکوسیستم بزرگتر است: نسخه HTML / کتاب کامپایل شده آزمایشگاه‌ها از طریق یک مخزن «کتاب» همراه منتشر می‌شود که نسخه‌ای اصلاح‌شده و قابل مرور از مطالب را ارائه می‌دهد. محتوا موضوعاتی مانند پردازش داده‌ها در R، استنتاج آماری، گردش‌های کاری ژنومیک، بسته‌های Bioconductor و تحلیل‌های مبتنی بر پروژه را پوشش می‌دهد. از آنجا که باز و ماژولار است، مشارکت‌کنندگان می‌توانند پیشنهاد بهبود، به‌روزرسانی ماژول‌ها یا اضافه کردن تمرین‌های جدید را ارائه دهند.
امکانات
- آزمایشگاه‌ها و تمرین‌های منبع در R Markdown برای دوره ژنومیک PH525x / HarvardX
- ساختار ماژولار که شامل پردازش داده‌ها، مدل‌سازی آماری و گردش‌های کاری ژنومیک می‌شود
- متن‌باز و تحت مجوز MIT برای مشارکت‌های اجتماعی منتشر شده است
- ادغام در یک «کتاب» کامپایل‌شده برای مشاهده وب و خروجی HTML در مخزن همراه
- دانشجویان فایل‌های Rmd را اجرا، اصلاح و ادغام می‌کنند تا تحلیل‌های عملی را انجام دهند.
- استفاده از Bioconductor و بسته‌های داده برای مجموعه داده‌های ژنومیک واقعی را پوشش می‌دهد.
زبان برنامه نویسی
R
دسته بندی ها
این برنامه‌ای است که می‌توان آن را از https://sourceforge.net/projects/genomics-labs.mirror/ نیز دریافت کرد. این برنامه در OnWorks میزبانی شده است تا بتوان آن را به ساده‌ترین روش به صورت آنلاین از یکی از سیستم‌های عامل رایگان ما اجرا کرد.
