این برنامه لینوکس به نام Hamstr است که آخرین نسخه آن را می توان با نام hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام Hamstr را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
Hamstr
Ad
شرح
HaMStR به https://github.com/bionf/hamstr جایی که اکنون بخشی از بسته HaMStR-OneSeq است.
HaMStR یک ابزار مبتنی بر مدل مارکوف پنهان پروفایل برای جستجوی ارتولوگ هدایت شده در داده‌های EST یا توالی پروتئین است. این برنامه یک گروه اصلی از پیش تعریف شده از دنباله‌های ارتولوگ (ارتولوگ‌های هسته) و مجموعه‌ای از توالی‌ها را از یک تاکسون جستجو به عنوان ورودی می‌گیرد. سپس HaMStR در یک استراتژی دو مرحله‌ای، جستجوی مبتنی بر pHMM و جستجوی معکوس را از طریق BLAST ترکیب می‌کند تا گروه ارتولوگ هسته را با توالی‌های جدید از تاکسون جستجو گسترش دهد.
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پرل
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/hamstr/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
