این برنامه لینوکس به نام MAGeCK است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام MAGeCK را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
MAGeCK
شرح
تجزیه و تحلیل مبتنی بر مدل ژنوم CRISPR-Cas9 Knockout (MAGeCK) یک ابزار محاسباتی برای شناسایی ژن های مهم از فناوری صفحه نمایش حذفی CRISPR-Cas9 در مقیاس ژنوم اخیر است.
برای دستورالعمل ها و مستندات، لطفاً به صفحه ویکی مراجعه کنید.
MAGeCK توسط Wei Li و Han Xu از آزمایشگاه دکتر Xiaole Shirley Liu در موسسه سرطان Dana-Farber/مدرسه بهداشت عمومی هاروارد توسعه یافته است و توسط آزمایشگاه Wei Li در مرکز ملی پزشکی کودکان نگهداری می شود. ما از حمایت برنامه کلودیا آدامز بار در تحقیقات نوآورانه اولیه سرطان و NIH/NHGRI برای توسعه MAGeCK تشکر می کنیم.
امکانات
- محبوب ترین الگوریتم محاسباتی در تحلیل غربالگری
- بیش از 400 نقل قول و 60 هزار بارگیری
- خط لوله ساده و آسان برای غربال کردن ژن ها در آزمایشات CRISPR-Cas9 Knockout در ژنوم
- یک مستند کامل با آموزش های آسان برای شروع
- حساسیت بالا و نرخ کشف نادرست پایین
- حفظ فعال کد منبع با ویژگی های جدید و رفع اشکال
- پشتیبانی از توسعه دهندگان و جامعه کاربر
- مجموعه ای از ویژگی های تجسم که ارقام استاندارد انتشار را ایجاد می کند
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پایتون، سی
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/mageck/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
