این برنامه لینوکس به نام MARAGAP است که آخرین نسخه آن را می توان با نام Data-Maragap.rar دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام MARAGAP را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
MARAGAP
Ad
شرح
این مقاله «MARAGAP»، یک خط لوله مونتاژ ژنوم به کمک مرجع را ارائه می‌کند. MARAGAP از اصل حداقل طول توصیف برای تعیین دنباله مرجع بهینه برای مجموعه استفاده می کند. توالی مرجع بهینه به عنوان الگویی برای استنتاج وارونگی ها، درج ها، حذف ها و SNP ها در ژنوم هدف استفاده می شود. MARAGAP از یک رویکرد الگوریتمی برای تشخیص و تصحیح وارونگی‌ها و حذف‌ها، یک رویکرد مبتنی بر نمودار De-Bruijn برای استنباط درج‌ها، یک ابزار هم‌ترازی محلی شکاف affine-match برای تخمین مکان آن درج‌ها و یک چارچوب تخمین بیزی برای SNPها استفاده می‌کند.این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/refasp/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
