این برنامه لینوکس به نام MendelChecker است که آخرین نسخه آن را می توان با نام MendelChecker_v2.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام MendelChecker را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
مندل چکر
Ad
شرح
MendelChecker اندازه گیری مبتنی بر احتمال برای تفکیک مندلی از پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در شجره های هسته ای است. ما این روش را بهعنوان یک معیار کنترل کیفیت برای کشف انواع جدید از دادههای توالییابی نسل بعدی پر سر و صدا در شجرهنامهها، مانند توالییابی DNA مرتبط با مکان (RAD-seq) در ارگانیسمهای غیرمدل توسعه دادیم. این روش مقایسه انتقال هتروگامتیک در مقابل همگامی، یعنی جداسازی وابسته به جنسیت در مقابل جداسازی اتوزومال را اجرا میکند.
امکانات
- اندازه گیری احتمال انتقال مندلی در شجره نامه
- تخصیص کروموزوم اتوزوم در مقابل جنسیت
- خروجی استاندارد GATK را می خواند
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.