این برنامه لینوکس به نام ParDRe است که آخرین نسخه آن را می توان با نام ParDRe-rel2.2.5.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام ParDRe را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
ParDRe
Ad
شرح
ParDRe یک ابزار موازی برای حذف خواندن های تکراری است. خواندن های تکراری را می توان یکسان دید
یا توالی های تقریباً یکسان با برخی عدم تطابق. این ابزار به کاربران اجازه می دهد تا از تجزیه و تحلیل خواندن های غیر ضروری اجتناب کنند، و زمان رویه های بعدی را با مجموعه داده کاهش می دهد (به عنوان مثال، مجموعه ها، نگاشت ها، و غیره).
این ابزار با MPI به منظور بهره برداری از قابلیت های موازی چند هسته ای پیاده سازی شده است
خوشه ها این سریعتر از همتایان چند رشته ای (پایان سال 2015) برای همان تعداد هسته است و به لطف فناوری ارسال پیام، می توان آن را روی خوشه ها اجرا کرد.
همچنین یک همتای MapReduce برای ParDRe وجود دارد که MarDRe نامیده می شود (به لینک بالا مراجعه کنید).
به روز رسانی: از نسخه 2.0.5 ParDRe همچنین برای حذف تنها موارد تکراری نوری (و باقی گذاشتن موارد تکراری جالب بیولوژیکی) و همچنین کار با ورودی/خروجی فشرده با فرمت .gz پشتیبانی می کند.
مخاطبان
فناوری اطلاعات، صنعت بهداشت و درمان، علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول/ترمینال، خط فرمان
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/pardre/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
