این برنامه لینوکس با نام SplitMEM است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان splitmem.1.0.tgz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام SplitMEM را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
SplitMEM
Ad
شرح
با ظهور فن‌آوری‌های توالی‌یابی بهبودیافته، ژنومیک از یک الگوی مرجع واحد برای هر گونه به یک رویکرد پان ژنوم جامع‌تر با افراد متعددی که با هم نشان داده و تحلیل می‌شوند، گسترش می‌یابد. در اینجا ما یک الگوریتم جدید زمان و مکان O(n log n) به نام splitMEM را معرفی می‌کنیم که مستقیماً نمودار فشرده‌شده de Bruijn را برای یک پان ژنوم با طول کل n می‌سازد. برای دستیابی به این پیچیدگی زمانی، درخت پسوند را با پسوند skips تقویت می‌کنیم، ساختار جدیدی که به ما امکان می‌دهد چندین پیوند پسوندی را در زمان ثابت طی کنیم و از آنها برای تجزیه مؤثر حداکثر مطابقت‌های دقیق (MEM) در طول پیمایش درخت پسوند استفاده کنیم.
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/splitmem/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
