این برنامه لینوکس به نام SWAPHI-LS: Alignment در Xeon Phi Cluster برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه را با نام SWAPHI-LS: Alignment در Xeon Phi Cluster به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
SWAPHI-LS: تراز کردن در Xeon Phi Cluster برای اجرای آنلاین در لینوکس
Ad
شرح
اولین الگوریتم موازی اسمیت-واترمن که از خوشه‌های Xeon Phi اینتل برای تسریع هم‌ترازی توالی‌های DNA طولانی استفاده می‌کند. این الگوریتم به زبان C++ (با مجموعه ای از پسوندهای ذاتی SIMD)، OpenMP و MPI نوشته شده است. ارزیابی عملکرد نشان داد که الگوریتم ما عملکرد بسیار پایداری را به دست می‌آورد و عملکردی تا 30.1 GCUPS در یک Xeon Phi و حداکثر تا 111.4 GCUPS در چهار Xeon Phis که یک میزبان را به اشتراک می‌گذارند، ارائه می‌کند.مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول/ترمینال، خط فرمان
زبان برنامه نویسی
++C
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
