این یک برنامه لینوکس به نام TOFSIMS است که آخرین نسخه آن را می‌توانید با نام tofsimssourcecode.tar.gz دانلود کنید. این برنامه را می‌توان به صورت آنلاین در ارائه دهنده خدمات میزبانی وب رایگان OnWorks برای ایستگاه‌های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام TOFSIMS with OnWorks را به صورت رایگان دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
TOFSIMS
شرح
پروژه tofsims یک جعبه ابزار R/Bioconductor است که برای پردازش، تجزیه و تحلیل و تجسم داده‌های طیف‌سنجی جرمی تصویربرداری از ابزارهای طیف‌سنجی جرمی یون ثانویه زمان پرواز (ToF-SIMS) طراحی شده است. این ابزار از وارد کردن داده‌های خام و پیش‌پردازش‌شده از پلتفرم‌های ابزار محبوب (مانند IONTOF، Ulvac-Phi) پشتیبانی می‌کند و روش‌هایی برای کالیبراسیون جرم، انتخاب پیک و ادغام پیک ارائه می‌دهد. این بسته امکان تبدیل طیف‌ها به ساختارهای تصویر دوبعدی (تصاویر جرمی) را با عملیاتی مانند binning، scaling، subsetting و رندر بصری فراهم می‌کند. برای کاوش داده‌ها و کاهش ابعاد، شامل روش‌های چند متغیره رایج در جامعه ToF-SIMS است: PCA (آنالیز مؤلفه اصلی)، MCR (تفکیک منحنی چند متغیره)، MAF (عوامل خودهمبستگی حداکثر) و MNF (کسری نویز حداقل). همچنین با پشته تصویربرداری Bioconductor (مانند EBImage) همکاری می‌کند تا کاربران بتوانند عملیات قطعه‌بندی و تجزیه و تحلیل تصویر را بر روی تصاویر جرمی اعمال کنند.
امکانات
- وارد کردن داده‌های خام و پیش‌پردازش‌شده ToF-SIMS از پلتفرم‌های مختلف ابزار دقیق
- کالیبراسیون جرم، انتخاب پیک و گردش‌های کاری ادغام پیک
- ساخت و دستکاری تصاویر جرمی دوبعدی (ترکیب، مقیاس‌بندی، زیرمجموعه‌بندی)
- تجزیه چند متغیره: PCA، MAF، MCR، MNF برای کاهش ابعاد و جداسازی سیگنال
- ادغام با ابزارهای تصویربرداری (مانند EBImage) برای عملیات قطعه‌بندی و ماسک فضایی
- مثال‌هایی از گردش‌های کاری و تصاویر برای هدایت پردازش داده‌ها از ابتدا تا انتها
زبان برنامه نویسی
R
دسته بندی ها
این برنامه‌ای است که می‌توان آن را از آدرس https://sourceforge.net/projects/tofsims.mirror/ نیز دریافت کرد. این برنامه در OnWorks میزبانی شده است تا بتوان آن را به ساده‌ترین روش به صورت آنلاین از یکی از سیستم‌های عامل رایگان ما اجرا کرد.
