این برنامه لینوکس به نام Virmid است که آخرین نسخه آن را می توان با نام Virmid-1.2.0.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام Virmid را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
ورمید
شرح
اخبار:
11-07-2013 نسخه جدید Virmid 1.1.0 آپلود شده است.
08/29/2013 مقاله Virmid اکنون در Genome Biology منتشر شده است.
کیم اس و همکاران، "ویرمید: تشخیص دقیق جهش‌های سوماتیک با استنتاج ناخالصی نمونه"، زیست‌شناسی ژنوم 2013، 14: R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Microdissection مجازی برای فراخوانی SNP) یک فراخوان نوع مبتنی بر جاوا است که برای نمونه های همسان با کنترل بیماری طراحی شده است. Virmid همچنین برای شناسایی پتانسیل در آلودگی فردی که در آن نمونه بیماری نمی تواند به اندازه کافی خالص شود، تخصصی است. در حالی که نرخ فراخوانی SNP با این ناهمگونی به شدت به خطر افتاده است، Virmid میتواند SNPهایی را با فرکانس آللی پایین با در نظر گرفتن سطح آلودگی (آلفا) کشف کند. ویژگی های مهم Virmid عبارتند از:
•برآورد تناسب دقیق نمونه شاهد در یک نمونه بیماری (مخلوط).
• بهبود SNP و فراخوانی جهش سوماتیک با توجه به نسبت تخمینی
امکانات
- یافتن جهش سوماتیک
- نمونه استنتاج ناخالصی
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
جاوه
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/virmid/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
