این برنامه ویندوز با نام BLAST Ring Image Generator است که آخرین نسخه آن را می توان با نام BRIG-0.95-dist.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام BLAST Ring Image Generator را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
BLAST Ring Image Generator
شرح
BRIG یک برنامه کاربردی بین پلتفرمی (ویندوز/مک/یونیکس) است که می‌تواند مقایسه‌های دایره‌ای بین تعداد زیادی از ژنوم‌ها را با تمرکز بر مدیریت داده‌های مونتاژ ژنوم نمایش دهد.اگر از BRIG برای تولید ارقام برای انتشارات استفاده می شود، لطفاً به مقاله BRIG استناد کنید: NF Alixan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): مقایسه های ساده ژنوم پروکاریوت ها, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
امکانات
- تصاویر شباهت بین یک توالی مرجع مرکزی و سایر توالی ها به عنوان حلقه های متحدالمرکز را نشان می دهند.
- BRIG تمام مقایسه های BLAST و تجزیه فایل ها را به صورت خودکار از طریق یک رابط کاربری گرافیکی ساده انجام می دهد.
- مرزهای Contig و پوشش خوانده شده را می توان برای پیش نویس ژنوم نمایش داد. نمودارها و حاشیه نویسی های سفارشی را می توان نمایش داد.
- با استفاده از مجموعه‌ای از ژن‌های تعریف‌شده توسط کاربر به‌عنوان ورودی، BRIG می‌تواند حضور، عدم حضور، برش یا تغییرات توالی ژن را در مجموعه‌ای از ژنوم‌های کامل، ژنوم‌های پیش‌نویس یا حتی داده‌های توالی خام و مونتاژ نشده نمایش دهد.
- BRIG همچنین فایل‌های نقشه‌خوانی با فرمت SAM را می‌پذیرد که امکان مقایسه همزمان نواحی ژنومی موجود در داده‌های توالی مونتاژ نشده از چندین نمونه را فراهم می‌کند.
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
جاوه
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/brig/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
