این برنامه ویندوز با نام Gen3D است که آخرین نسخه آن را می توان با نام gen3d.cpp دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام Gen3D را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
Gen3D
شرح
Gen3D برنامه ای است که برای تعیین مدل های سه بعدی ژنوم و کروموزوم طراحی شده است. از داده های تماس کروموزومی برای ساختن ترکیبات سه بعدی استفاده می کند. این روش می تواند مدل های کروموزومی سه بعدی تولید کند که بخش بزرگی از تماس های کروموزومی را برآورده می کند.
این نرم افزار در آزمایشگاه بیوانفورماتیک، داده کاوی و یادگیری ماشین پروفسور جیانلین چنگ در بخش علوم کامپیوتر در دانشگاه میسوری - کلمبیا، ایالات متحده توسعه یافته است. این پروژه توسط بنیاد ملی علوم (با شماره کمک مالی DBI1149224) پشتیبانی می شود.
اگر از Gen3D در تحقیقات خود استفاده می کنید، لطفاً به موارد زیر اشاره کنید:
نووتنی، جکسون، شریف احمد، لینگفی زو، اولواتوسین اولوواداره، هانا چن، نوئلان هنسلی، تون تریو، رنژی کائو، و جیانلین چنگ. "بازسازی تکراری مدل های سه بعدی کروموزوم های انسانی از داده های تماس کروموزومی." BMC بیوانفورماتیک 16، شماره. 1 (2015): 338.
امکانات
- از داده های تماس کروموزومی به دست آمده با استفاده از تکنیک Hi-C استفاده کنید
- از داده‌های تماس کروموزومی، مدل‌های ژنوم و کروموزوم ساختاری سه بعدی بسازید
- با استفاده از رویکرد احتمالی مختصات را مقداردهی کنید
- روش جدید برای نشان دادن تماس های رضایت بخش در ماتریس نقشه حرارتی
- طرح های امتیازدهی برای تعیین مخاطبین برد بلند و کوتاه
- در مقایسه با سایر روش‌های موجود و همچنین اعتبارسنجی با ویژگی‌های ژنومی
مخاطبان
علوم/تحقیقات، مهندسی
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/gen3d/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
