این برنامه ویندوز به نام Javamony برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام Javamony.jar دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه به نام Javamony را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
Javamony برای اجرای آنلاین در ویندوز از طریق لینوکس به صورت آنلاین
شرح
بر اساس Pysimony نه چندان موفق (https://sourceforge.net/projects/pysimony/)، همان دانش آموز مصمم به مشکل فیلوژنتیکی دست می زند.Javamony به صورت زیر فراخوانی می شود:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [تصادفی / گام به گام (درخت شروع)] [# بوت استرپ] [تاکسون برون گروهی شماره 1] [تاکسون برون گروهی شماره 2] ...
جاوامونی که به عنوان یک برنامه استنتاج فیلوژنتیک رقابتی نیست، فرصتی برای من است تا زبان جاوا را در حین یادگیری رسیدگی و حل مشکلات اساسی در فیلوژنتیک به دست بیاورم. بنابراین، برای منافع آموزشی خودم، همه کدها اورجینال هستند. البته احتمالاً اشتباهات زیادی نیز وجود دارد.
من جاوامونی را مانند Pysimony توزیع می کنم، به این امید که برای شخص دیگری ارزش آموزشی داشته باشد یا حداقل به طور مبهم سرگرم کننده باشد.
ویژگی های آینده خواهد بود:
- پشتیبانی از توالی های اسید آمینه
- پشتیبانی از فرمت های فایل اضافی (مانند Nexus)
- چند رشته ای
- روش‌های امتیازدهی اضافی (مثلاً حداکثر احتمال)
امکانات
- از حداکثر صرفه جویی استفاده می کند
- یک فایل ورودی FASTA را می خواند (فقط DNA)
- گروه برون مرزی ایجاد شده توسط کاربر
- درختان شروع تصادفی و گام به گام
- از جستجوی درخت SPR (هرس زیر درخت و پیوند مجدد) استفاده می کند
- بوت استرپینگ را انجام می دهد
- فرمت استاندارد نیویک را با پشتیبانی از بوت استرپ و طول شاخه ها خروجی می دهد
- درخت نهایی را با پشتیبانی بوت استرپ ترسیم می کند
مخاطبان
علم/تحقیق، آموزش
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
جاوه
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/javamony/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
