این برنامه ویندوز به نام ShuffleFastaSeq است که آخرین نسخه آن را می توان با نام ShuffleFastaSeq.exe دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام ShuffleFastaSeq را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
ShuffleFastaSeq
شرح
ShuffleFastaSeq یک برنامه فرمت ویندوز است که به زبان سی شارپ نوشته شده است تا توالی های با فرمت FASTA را به هم بزند. جایگشت تصادفی با استفاده از یک تغییر ساده از الگوریتم فیشر-یتس پیاده سازی شده توسط دورستنفلد به دست می آید.https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) ( Knuth DE. The art of computer programming: seminumerical algorithms. 3rd ed. Boston: Addison-Wesley; 1997). فایل ورودی حاوی یک یا چند دنباله در قالب FASTA است. تعداد درهم ریختگی (n) برای هر دنباله را می توان تنظیم کرد. به طور پیش‌فرض n 100 است. فایل خروجی شامل n کپی به هم ریخته در قالب FASTA برای هر دنباله ورودی است.
به عنوان مثال (n=3):
فایل ورودی:
>a
ACGGT
>b
GCCCATTC
فایل خروجی:
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
Win32 (MS Windows)
زبان برنامه نویسی
C#
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
