Il s'agit de la commande arden-analyze qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS.
PROGRAMME:
Nom
arden-analyze - analyser les résultats de la cartographie artificielle du génome de référence
SYNOPSIS
arden-analyser [Options] [CONTRIBUTION DOSSIER] [DOSSIER DE SORTIE]...
DESCRIPTION
Script pour analyser les résultats de la cartographie artificielle du génome de référence. Ce scénario
identifie les TP/FP putatifs sur un ensemble de données spécifique (lectures).
OPTIONS
DOSSIER DE SORTIE
chemin d’accès au dossier de destination de sortie.
CONTRIBUTION DOSSIER
ppath vers le fichier ini. Pour obtenir le format requis, consultez les exemples de fichiers.
--version
afficher le numéro de version du programme et quitter
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-p PHRÉD, --phred=PHRÉDÉ
Spécifiez le codage PHRED des lectures d'entrée, c'est-à-dire Illumina 1.3+ = -p 33.[par défaut :
33]
-r RANG, --rang interne=RANG
Utiliser le classement interne pour les lectures (nécessaire si les noms de lecture ne peuvent pas être
être trié lexicographiquement de la même manière en python et dans votre système d'exploitation par sam
outils).[par défaut:1]
Utilisez arden-analyze en ligne à l'aide des services onworks.net
