Il s'agit de la commande bp_gccalcp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_gccalc - Contenu GC des séquences nucléotidiques
SYNOPSIS
bp_gccalc [-f/--format FORMAT] [-h/--help] nom de fichier
or
bp_gccalc [-f/--format FORMAT] < nom de fichier
or
bp_gccalc [-f/--format FORMAT] -i nom de fichier
DESCRIPTION
Ce script imprime le contenu du GC pour chaque séquence de nucléotides du fichier d'entrée.
OPTIONS
Le format de séquence par défaut est fasta.
L'entrée de séquence peut être fournie à l'aide de l'une des trois méthodes suivantes :
argument sans nom
nom de fichier bp_gccalc
argument nommé
bp_gccalc -i nom de fichier
entrée standard
bp_gccalc < nom de fichier
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AUTEUR - Jason Stadjich
Email [email protected]
HISTOIRE
Basé sur le code de script (voir en bas) soumis par [email protected]
Soumis dans le cadre du projet de script bioperl 2001/08/06
Utilisez bp_gccalcp en ligne en utilisant les services onworks.net
