Il s'agit de la commande bp_mrtransp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_mrtrans - implémenter un transformateur d'alignements de protéines aux coordonnées mrna
SYNOPSIS
Usage:
bp_mrtrans -i inputfile -o outputfile [-if format d'entrée] [-of format de sortie] [-s ADNc
base de données de séquences] [-sf format de séquence d'ADNc] [-h]
DESCRIPTION
Ce script reconvertira un alignement de protéines en un ADNc. Librement basé sur Bill
mrtrans de Pearson.
Les options sont:
-o nom_fichier - le nom du fichier de sortie [STDOUT par défaut]
-of format - format de séquence de sortie
(alignement de séquences multiples)
[phylip par défaut]
-i nom de fichier - le nom de fichier d'entrée [obligatoire]
-if format - format de séquence d'entrée
(alignement de séquences multiples)
[clustalw par défaut]
-s --seqdb filename - le fichier de base de données de séquences d'ADNc
-sf --seqformat - le format cDNA seq db (format de séquence de fichier plat)
-h - ce menu d'aide
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