Il s'agit de la commande br_biofetch qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
br_biofetch.rb — client biofetch
SYNOPSIS
br_biofetch.rb [-s serveur] [db] [id] [style] [format]
DESCRIPTION
Cette page de manuel documente brièvement les br_biofetch.rb.
br_biofetch.rb est un client biofetch très simple. Vous pouvez vous connecter à un serveur biofetch et
récupérer les entrées de la base de données, y compris les informations de séquence.
OPTIONS
-s Spécifiez l'URL du BioFetch CGI (la valeur par défaut est http://bioruby.org/cgi-
bin/biofetch.rb)
-e Utilisez le serveur EBI à http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch
-r Utilisez le serveur BioRuby à http://bioruby.org/cgi-bin/biofetch.rb
db Nom de la base de données. Cela inclut des options telles que refseq, genbank, embl, swissprot, etc.
Cette option dépend du serveur biofetch que vous utilisez.
id identifiant d'entrée
Catégorie 'raw' ou 'html' (la valeur par défaut est 'raw')
le format Format de sortie ('default, 'fasta', 'etc')
Utilisez br_biofetch en ligne en utilisant les services onworks.net