Il s'agit de la commande cassiopee qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
cassiopee - page de manuel pour Cassiopee version 1.0
SYNOPSIS
cassiopée [Options]
DESCRIPTION
Usage:
-l: profondeur d'index maximale / taille de motif maximale
-u: enregistrer l'index pour une utilisation ultérieure
-s: séquence à indexer
-p: motif à rechercher
-f: fichier contenant le motif à rechercher
-o: fichier de sortie
-r: appliquer la réduction d'arbre
-m: mode de recherche : 0=ADN, 1=ARN, 2=Protéine
-a: autoriser la recherche d'ambiguïté alphabétique
-n: max N matchs consécutifs autorisés dans la recherche
-e : substitution maximale autorisée pour les correspondances dans la recherche
-i: nombre maximal de correspondances autorisées dans la recherche
-g: génère un fichier de points du graphique
-d: profondeur max du graphe
-t: format de sortie : 0:tsv (par défaut), 1:json
-x: position minimale dans la séquence
-y: position maximale dans la séquence
-v: afficher la version
-h: afficher ce message
Utilisez cassiopee en ligne en utilisant les services onworks.net
