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cmtk-dcm2image - En ligne dans le Cloud

Exécutez cmtk-dcm2image dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks sur Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

Il s'agit de la commande cmtk-dcm2image qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

Nom


dcm2image - DICOM en image

SYNOPSIS


dcm2image ListeRépertoireRecherche

DESCRIPTION


Combinez des ensembles de tranches DICOM en piles d'images 3D

OPTIONS


Global Boîte à outils Options (celles-ci sommes-nous a partagé la publication de by tous CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.

--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.

- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.

--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.

--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.

--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.

--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.

--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).

--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).

Entrée Options
--pas de progrès
Désactivez les rapports de progression.

Entrée Options
--récurseur, -r
Parcourir les répertoires

Sortie Options
--out-motif , -O
Modèle de chemin de l'image de sortie. Utilisez les substitutions suivantes : printf-style %d variante
(numéro d'image); %n (numéro d'image avec nombre automatique de chiffres) ; %N (comme %n, mais
avec un tiret '-' avant le numéro s'il y a plus d'une image); %D (DICOM
Description de la série); %R (DICOM RepetitionTime - IRM uniquement) ; %E (DICOM EchoTime - IRM
seul); %T (RawDataType - spécifique au fournisseur, actuellement GE MRI uniquement) [Défaut:
image%n.nii ]

--xml, -x
Ecrivez un fichier annexe XML pour chaque image créée.

--include-identifiants
Inclure les informations d'identification potentiellement protégées (par exemple, les UID, le numéro de série de l'appareil
nombres, dates) dans les fichiers annexes XML créés.

--intégrer
Intégrez les informations DICOM dans les images de sortie en tant que « description » (si pris en charge par la sortie
format de fichier). Valeurs prises en charge : "StudyID_StudyDate", "PatientName",
"SeriesDescription", "Aucun", où la valeur par défaut est "Aucun", ou utilisez l'un des
Suivante à la suite:

--StudyID_StudyDate
StudyID, tag (0020,0010), puis soulignement, suivi de StudyDate, tag
(0008,0020). La date est ajoutée car StudyID est composé de quatre chiffres seulement et
répéter tôt ou tard.

--Nom du patient
Nom du patient, étiquette (0010,0010)

--Description de la série
Description de la série, étiquette (0008,103e)

--Rien
Intégrer aucune information - laisser le champ 'description' vide. [Ce is le défaut]

Filtration Options
--filtre
Filtrez les fichiers DICOM et n'incluez que ceux correspondant au modèle donné du formulaire
'TagName=text', de sorte que la valeur de la balise DICOM avec le nom donné contienne le
texte donné. Si plusieurs modèles de filtre sont fournis via l'utilisation répétée de cette option,
seuls les fichiers qui correspondent à TOUS les modèles sont inclus.

--exclure
Exclure tous les fichiers DICOM correspondant au modèle donné de la forme 'TagName=text', tel
que la valeur de la balise DICOM avec le nom donné contient le texte donné. Si
plusieurs modèles d'exclusion sont fournis, tous les fichiers sont exclus qui correspondent à N'IMPORTE QUEL
les motifs.

tri Options
--pas de tri
Ne triez PAS les fichiers par nom de fichier (le tri détermine l'ordre de la pile d'images lors de la résolution
collisions spatiales)

--Trier par nom
Triez les fichiers lexicographiquement par nom de fichier. Utilisez ceci lorsque les numéros d'instance ne sont pas
unique.

--sort-par-instance
Triez les fichiers par numéro d'instance d'image. Utilisez ceci lorsque les noms de fichiers sont de longueurs différentes,
et ainsi de suite [Ce is le défaut]

Empilement Options
--write-single-tranches
Ecrivez également des images de sortie pour les fichiers DICOM à tranche unique qui n'ont pas pu être affectés à
toutes les piles 3D. Par défaut, ceux-ci sont ignorés.

--ignore-numéro-acq
Ignorez la balise 'AcquisitionNumber' pour le regroupement d'images, c'est-à-dire ne séparez pas les piles en fonction
sur cette balise.

--pas de vérification d'orientation
Désactiver la vérification des orientations de l'image (pour éviter les problèmes d'arrondi)

--tolérance
Tolérance pour les comparaisons à virgule flottante (doit être >= 0 ; 0 = correspondances exactes uniquement ;
par défaut : 1e-5). Si un ou plusieurs volumes ne peuvent pas être empilés en raison d'une tranche non uniforme
espacement qui dépasse ce seuil, dcm2image renverra un code de sortie de 3.
[Défaut: 1e-05]

AUTEURS


Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko

Utilisez cmtk-dcm2image en ligne à l'aide des services onworks.net


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