cmtk-mcwarp – En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

mcwarp - Enregistrement non rigide multicanal

SYNOPSIS

mcwarp [options] mcaffineSortie

DESCRIPTION

Enregistrement d'images B-splines non rigides multicanaux à l'aide d'un histogramme ou d'une covariance
mesures d'entropie conjointe basées sur

OPTIONS

Global Boîte à outils Options (celles-ci sommes-nous a partagé la publication de by tous CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.

--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.

- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.

--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.

--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.

--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.

--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.

--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).

--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).

Entrée Options
--out-archive , -o
Chemin de l'archive de sortie. [Défaut: RIEN]

--sous-échantillon-à partir de , -d
Facteur de sous-échantillonnage initial [1]. [Défaut: 1]

--sous-échantillonner-à , -D
Facteur de sous-échantillonnage final [1]. [Défaut: 1]

--downsample-moyenne
Sous-échantillonnage à l'aide d'une moyenne à fenêtre glissante [par défaut : off] ) [Défaut: 0]

--lisse
Sigma du noyau de lissage gaussien en multiples de la taille en pixels de l'image du modèle
[par défaut : désactivé] ) [Défaut: 0]

--grille-espacement
Espacement initial de la grille des points de contrôle en mm. [Défaut: 40]

--espacement-de-grille-exact
Espacement initial exact de la grille, même s'il ne correspond pas au champ de vision de l'image. [Défaut: désactivée]

--affiner-grille
Nombre de raffinements de la grille de points de contrôle. [Défaut: 0]

--retarder-affiner-grille
Retardez le raffinement de la grille de points de contrôle jusqu'après le raffinement des pixels.

--facteur de seuil de correction adaptative
Facteur de seuil d'intensité [0..1] pour la fixation adaptative des paramètres. [par défaut : 0 -- non
fixation] [Défaut: 0]

--adaptive-fix-thresh-factor-entropy
Facteur de seuil d'entropie [0..1] pour la fixation adaptative des paramètres. [par défaut : 0 -- non
fixation] [Défaut: désactivée]

--fix-warp-x
Correction de la transformation (ne pas déformer) dans la direction x.

--fix-warp-y
Correction de la transformation (ne pas déformer) dans la direction y.

--fix-warp-z
Correction de la transformation (ne pas déformer) dans la direction z.

--jacobian-contrainte-poids
Poids pour la contrainte de préservation du volume jacobien [Défaut: 0]

--histogrammes, -H
Utiliser des histogrammes multidimensionnels pour calculer les entropies [par défaut. [Ce is le
défaut]

--covariance, -C
Utiliser les déterminants de la matrice de covariance pour calculer les entropies.

--cubique, -c
Utiliser l'interpolation cubique [par défaut : linéaire]

--mi Utiliser la métrique d'information mutuelle standard [par défaut] [Ce is le défaut]

--nmi
Utiliser une métrique d'information mutuelle normalisée

--correction d'intensité, -I
Corriger les intensités d'image en utilisant la transformation locale Jacobienne pour préserver le total
signal

--taille-étape-initiale
Taille du pas initial de l'optimiseur en pixels. [Défaut: 1]

--final-step-taille
Taille du pas initial de l'optimiseur en pixels. [Défaut: 0.125]

--delta-f-seuil
Seuil facultatif pour terminer l'optimisation (niveau) si changement relatif de cible
fonction descend en dessous de cette valeur. [Défaut: 0]

AUTEURS

Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko

Utilisez cmtk-mcwarp en ligne à l'aide des services onworks.net