Il s'agit de la commande cmtk-symplx qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
symplx - Calcul du plan de symétrie
SYNOPSIS
simplx Image d'entrée
DESCRIPTION
Calculez le plan de symétrie approximatif d'une image pour déterminer, par exemple, le milieu
plan sagittal dans les images du cerveau humain. Diverses formes de sortie sont prises en charge, par exemple, l'écriture
l'image d'entrée avec le plan de symétrie dessiné dedans, ou l'image d'entrée réalignée le long
le plan de symétrie.
OPTIONS
Global Boîte à outils Options (celles-ci sommes-nous a partagé la publication de by tous CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.
--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.
- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.
--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.
--xml
Écrivez la spécification de la syntaxe de la ligne de commande dans le balisage XML (pour l'intégration de Slicer).
--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.
--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.
--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.
--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).
--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).
Optimisation
--précision , -a
Précision (taille de l'étape d'optimisation finale en [mm]. [Défaut: 0.1]
--échantillonnage , -s
Résolution d'image rééchantillonnée. C'est la résolution [en mm] du premier (le plus fin)
image rééchantillonnée dans la pyramide multi-échelle, qui est directement dérivée de la
images originales en pleine résolution. [Défaut: 1]
--niveaux , -l
Nombre de niveaux de résolution. L'algorithme créera (niveaux-1) des images rééchantillonnées
avec une résolution de plus en plus grossière et les utiliser dans l'ordre successif d'augmentation
résolution avant d'utiliser les images originales au niveau final. [Défaut: 4]
--fix-décalage
Correction du décalage du plan de symétrie. Réduit le temps de calcul et force le plan de symétrie à
croix centre de masse, mais peut conduire à un résultat moins que précis.
Initiales approximatif symétrie avion orientation
--plan initial
Orientation initiale du plan de symétrie. Ce doit être le plan orthogonal le plus proche de
le plan de symétrie réel attendu. Valeurs prises en charge : "initial-axial", "initial-
coronale", "initial-sagittal", "initial-xy", "initial-xz", "initial-yz", où le
la valeur par défaut est "initial-sagittal", ou utilisez l'un des éléments suivants :
--initial-axial
Symétrie approximativement axiale
--initiale-coronaire
Environ symétrie coronale
--initial-sagittal
Symétrie approximativement sagittale [Ce is le défaut]
--initial-xy
Environ symétrie plane XY
--initial-xz
Environ XZ symétrie plane
--initial-yz
Environ YZ symétrie plane [Ce is le défaut]
Pré-calculé symétrie
--sortie-seulement
Donnez les paramètres de symétrie [Rho Theta Phi] en option, ignorez la recherche. [Défaut: désactivée]
--fichier-de-sortie-uniquement
Lire les paramètres de symétrie du fichier, ignorer la recherche. [Défaut: désactivée]
Date pré-traitement
--valeur-min
Forcer la valeur minimale des données. [Défaut: désactivée]
--Valeur max
Forcer la valeur maximale des données. [Défaut: désactivée]
Sortie of Images
--interpolation
Méthode d'interpolation utilisée pour les données de sortie reformatées Valeurs prises en charge : « linéaire »,
"cubic", "sinc", où la valeur par défaut est "linear", ou utilisez l'un des éléments suivants :
--linéaire, -L
Utilisez l'interpolation d'image linéaire pour la sortie. [Ce is le défaut]
--cubique, -C
Utilisez l'interpolation d'image cubique pour la sortie.
--sinc, -S
Utilisez l'interpolation d'image sinc fenêtrée en cosinus pour la sortie.
--pad-out , -P
Valeur de remplissage pour les images de sortie. [Défaut: désactivée]
--mark-value
Valeur de données pour marquer (dessiner) le plan de symétrie. [Défaut: 4095]
--write-marqué
Nom de fichier pour l'image de sortie avec plan de symétrie marqué. [Défaut: RIEN]
--écriture-alignée
Nom de fichier pour l'image de sortie alignée sur le plan de symétrie. [Défaut: RIEN]
--mark-aligné
Marquez le plan de symétrie dans l'image de sortie alignée.
--écrire-soustraire
Nom de fichier pour l'image de soustraction miroir. [Défaut: RIEN]
--write-miroir
Nom de fichier de l'image en miroir par rapport au plan de symétrie. [Défaut: RIEN]
Sortie of Paramètres
--fichier de sortie , -o
Nom de fichier pour la sortie des paramètres du plan de symétrie. [Défaut: RIEN]
--write-xform
Écrire la transformation d'alignement affine dans le fichier [Défaut: RIEN]
AUTEURS
Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko
Utilisez cmtk-symplx en ligne en utilisant les services onworks.net
