Il s'agit de la commande cmtk-unwarp_image_phantom qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS.
PROGRAMME:
Nom
unwarp_image_phantom - Créer une transformation pour déformer une image basée sur un fantôme
la description
SYNOPSIS
déformer_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform
DESCRIPTION
Cet outil calcule soit une transformation polynomiale, soit une déformation de forme libre B-spline pour
déformer une image. La transformation s'appuie sur des repères attendus et détectés dans un
image d'un fantôme structurel acquise sur le même scanner. Utilisez le 'detect_adni_phantom'
outil pour détecter les points de repère de l'ADNI Phantom dans une image et générer un fantôme
fichier de description adapté à une utilisation avec cet outil.
OPTIONS
Global Boîte à outils Options (celles-ci commun by TOUTE CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.
--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.
- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.
--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.
--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.
--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.
--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.
--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).
--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).
Essayage Options
--fit-inverse
Ajuster la transformation inverse (cartographie des emplacements de points de repère réels et attendus). C'est
utile pour calculer une carte de correction de volume jacobienne (en utilisant 'reformatx') sans
devoir inverser numériquement la transformation de déformation ajustée.
--fit-forward
Transformation adaptée (cartographie attendue avec les emplacements de points de repère réels). C'est
utile pour rectifier l'image via le retranchage (en utilisant 'reformatx'). [Ce is le
défaut]
De La Carrosserie Des modèles photo
--spline
Ajustement de la déformation de forme libre de la spline B.
--poly
Ajuster la transformation polynomiale. [Ce is le défaut]
Polynôme Essayage Options (avec --poly)
--degré
Degré de la transformation polynomiale ajustée. [Défaut: 4]
B-Splines Essayage Options (avec --spline)
--final-cp-espacement
Espacement de grille de point de contrôle final de la transformation B-spline de sortie. [Défaut: 0]
--final-cp-dims
Dimensions finales de la grille des points de contrôle (c'est-à-dire nombre de points de contrôle) de la sortie B-
transformation de spline. À fournir sous la forme 'dimX,dimY,dimZ'. [Défaut: RIEN]
--niveaux
Nombre de niveaux dans la procédure d'approximation B-spline multi-niveaux. [Défaut: 1]
--itérations par niveau
Nombre maximum d'itérations de mise à jour du coefficient de spline par niveau dans le multi-niveau
Procédure d’approximation B-spline. [Défaut: 100]
--rms-seuil
Seuil d’amélioration relative du résidu d’ajustement RMS. L'itération appropriée
se termine si (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < seuil.
[Défaut: 0]
--no-fit-affine
Désactivez l’ajustement de la transformation affine pour initialiser la spline. Ajustez plutôt la spline
directement. Cela donne généralement de moins bons résultats et est déconseillé.
AUTEURS
Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko
Utilisez cmtk-unwarp_image_phantom en ligne à l'aide des services onworks.net
