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drr - En ligne dans le Cloud

Exécutez drr dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks sur Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

Il s'agit de la commande drr qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

Nom


drr - créer une radiographie reconstruite numériquement

SYNOPSIS


drr [choix] [dans le fichier]

DESCRIPTION


Une radiographie reconstruite numériquement (DRR) est une radiographie synthétique qui peut être
généré à partir d'une tomodensitométrie (TDM). Elle est utilisée comme image de référence pour
vérifier la position d'installation correcte d'un patient avant la radiothérapie.

RRC UTILISATION


Le programme drr fourni avec plastimatch prend une image CT en entrée et en génère une
ou plusieurs images de sortie. L'image d'entrée est au format MHA et les images de sortie peuvent être
soit au format pgm, pfm ou brut. L'utilisation de la ligne de commande est :

Utilisation : drr [options] [dans le fichier]
Options:
-Un matériel Soit "cpu" ou "cuda" (défaut=cpu)
-a num Génère num angles équidistants
-N angle Différence entre les angles voisins (en degrés)
-nrm "xyz" Définit le vecteur normal pour le panneau
-vup "xyz" Définit le vecteur vup (vers la rangée du haut) pour le panneau
-g "triste sid" Définit le triste, sid (en mm)
-r "rc" Définit la résolution de sortie (en pixels)
-s scale Échelle l'intensité du fichier de sortie
-e Faire un mappage exponentiel des valeurs de sortie
-c "rc" Définit le centre de l'image (en pixels)
-z "s1 s2" Définit la taille physique de l'imageur (en mm)
-w "r1 r2 c1 c2" Ne produit une image que pour les pix dans la fenêtre (en pix)
-t outformat Sélectionnez le format de sortie : pgm, pfm ou raw
-i algorithme Choisir l'algorithme {exact, uniforme}
-o "o1 o2 o3" Définit la position de l'isocentre
-I infile Définir le fichier d'entrée au format mha
-O outprefix Génère des fichiers de sortie en utilisant le préfixe spécifié

Le programme drr peut être utilisé dans unique image mode or Rotatif mode. en simple
mode image, vous spécifiez la géométrie complète de la source de rayons X et du panneau d'imagerie pour un
image unique. En mode rotation, la géométrie d'imagerie est supposée être

Les options de ligne de commande sont décrites plus en détail comme suit.

-A matériel
Choisissez le mode d'enfilage, qui est soit "cpu" soit "cuda". La valeur par défaut est
"CPU".

Lors de l'utilisation de matériel CPU, la génération DRR utilise OpenMP pour l'accélération multicœur si
votre compilateur prend en charge cela. Gcc et Microsoft Visual Studio Professionnel
les compilateurs prennent en charge OpenMP, mais pas Microsoft Visual Studio Express.

À l'heure actuelle, l'accélération cuda ne fonctionne pas.

-a num Générer num angles équidistants

-r "r1 r2 "
Définissez la résolution du panneau d'imagerie (en pixels). Ici, r1 fait référence au nombre
de lignes et r2 fait référence au nombre de colonnes.

UNIQUE IMAGE MODE


L'exemple suivant illustre l'utilisation du mode image unique :

drr -nrm "1 0 0" \
-vup "0 0 1" \
-g "1000 1500" \
-r "1024 768" \
-z "400 300" \
-c "383.5 511.5" \
-o "0 -20 -50" \
fichier_entrée.mha

Dans l'exemple ci-dessus, l'isocentre est choisi pour être (0, -20, -50), l'emplacement marqué sur
l'image CT. L'orientation de l'image de projection est contrôlée par le Non ainsi que vuup
option. L'utilisation des valeurs par défaut de (1, 0, 0) et (0, 0, 1) donne le DRR affiché sur le
à droite : [image] [image]

En changeant la direction normale (Non), nous pouvons choisir différentes directions de faisceau dans un
orbite isocentrique. Par exemple, un DRR antéro-postérieur (AP) est généré avec un
de (0, -1, 0) comme indiqué ci-dessous : [image]

La rotation du panneau d'imagerie est sélectionnée à l'aide de la vuup option. La valeur par défaut de
vuup est (0, 0, 1), ce qui signifie que le haut du panneau est orienté vers le z positif
direction dans les coordonnées du monde. Si nous voulions faire pivoter le panneau de 45 degrés
dans le sens inverse des aiguilles d'une montre sur notre vue AP, nous définirions vuup dans la direction (1, 0, 1), comme indiqué dans
l'image ci-dessous. Noter que vuup n'a pas besoin d'être normalisé. [image]

ROTATION MODE


En mode rotationnel, plusieurs images sont créées. La source et le panneau d'imagerie sont supposés
tourner sur une orbite circulaire autour de l'isocentre. L'orbite circulaire est effectuée
autour de l'axe Z, et les images sont générées chaque -N ang degrés de l'orbite. Cette
est illustré à l'aide de l'exemple suivant :

dr -N 20 \
-un 18 \
-g "1000 1500" \
-r "1024 768" \
-z "400 300" \
-o "0 -20 -50" \
fichier_entrée.mha

Dans l'exemple ci-dessus, 18 images sont générées à un intervalle de 20 degrés, comme suit : [image]

Utilisez drr en ligne en utilisant les services onworks.net


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