Il s'agit de la commande extractUnmappedSubreads qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
extractUnmappedSubreads.py - Extrait les sous-lectures non mappées d'un fichier fasta
DESCRIPTION
utilisation : extractUnmappedSubreads.py [-h] [--verbose] [--version] [--profile]
[--déboguer]
rapide cmp.h5 [cmp.h5 ...]
Extrayez les sous-lectures non mappées d'un fichier fasta.
positionnel arguments:
fasta un fichier fasta contenant toutes les sous-lectures.
cmp.h5 d'entrée des fichiers cmp.h5.
optionnel arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
--verbeux, -v
Définir le niveau de verbosité (par défaut : aucun)
--version
afficher le numéro de version du programme et quitter
--profil
Imprimer le profil d'exécution à la sortie (par défaut : False)
--déboguer
Capturez les exceptions dans le débogueur (nécessite ipdb) (par défaut : False)
Utilisez extractUnmappedSubreads en ligne à l'aide des services onworks.net
