Il s'agit de la commande fastaq-to_fasta qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastaq_to_fasta - Convertit une variété de formats d'entrée au format FASTA bien formaté
DESCRIPTION
utilisation : fastaq_to_fasta [options]
Convertit une variété de formats d'entrée au format FASTA bien formaté
positionnel arguments:
infile Nom du fichier d'entrée. Peut être l'un des FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
fichier de sortie
Nom du fichier de sortie
optionnel arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-l LONGUEUR DE LA LIGNE, --longueur de la ligne LONGUEUR DE LA LIGNE
Nombre de bases sur chaque ligne de séquence du fichier de sortie. Mettre à zéro pour non
sauts de ligne dans les séquences [60]
-s, --strip_after_whitespace
Supprimez tout après le premier espace dans chaque nom de séquence
-u, --check_unique
Die si l'un des noms de séquence de sortie n'est pas unique
Utilisez fastaq-to_fasta en ligne en utilisant les services onworks.net
