Il s'agit de la commande fastaq-trim_contigs qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastaq_trim_contigs - Coupe un nombre défini de bases à la fin de chaque contig
DESCRIPTION
utilisation : fastaq_trim_contigs [options]
Coupe un nombre défini de bases à la fin de chaque contig, de sorte que les écarts deviennent plus grands et contig
les extrémités sont supprimées. Les bases sont remplacées par des Ns. Toute séquence qui se termine comme tous les N est perdue
positionnel arguments:
infile Nom du fichier d'entrée
fichier de sortie
Nom du fichier de sortie
optionnel arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
--trim_numéro TRIM_NUMBER
Nombre de bases à découper autour de chaque espace et hors extrémités de chaque séquence [100]
Utilisez fastaq-trim_contigs en ligne en utilisant les services onworks.net
