Il s'agit de la commande gmod_sort_gff3.plp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gmod_sort_gff3.pl - Trie un fichier GFF3 pour mettre les lignes avec les balises Parent après leur parent.
SYNOPSIS
% gmod_sort_gff3.pl --infile
LIGNE DE COMMANDE OPTIONS
--infile Nom du fichier gff3 d'entrée (obligatoire)
--outfile Nom du fichier gff3 de sortie
(par défaut : trié.gff)
DESCRIPTION
Il s'agit d'un script très simple (et seulement légèrement testé) pour trier les fichiers gff3 afin que tous
les lignes qui ont des balises parent viennent après la ligne qui contient la balise ID parent. Des dossiers
ainsi triés sont requis pour le chargeur en vrac GMOD chado, gmod_bulk_load_gff3.pl.
AUTEURS
Scott Caïn[email protected]>
Copyright (c) 2006
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termes comme Perl lui-même.
Utilisez gmod_sort_gff3.plp en ligne à l'aide des services onworks.net
