Il s'agit de la commande gmx-sigeps qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gmx-sigeps - Convertit les combinaisons c6/12 ou c6/cn vers et depuis sigma/epsilon
SYNOPSIS
sigeps gmx [-o [<.xvg>]] [-[maintenant] [-xvg ] [-c6 ]
[-cn ] [-pouvoir ] [-sig ] [-eps ]
[-A ] [-B ] [-C ] [-qi ]
[-qj ] [-sigfac ]
DESCRIPTION
gmx soupirs est un utilitaire simple qui convertit les combinaisons C6/C12 ou C6/Cn en sigma et
epsilon, ou vice versa. Il peut également tracer le potentiel dans le fichier. De plus, il fait un
approximation d'un potentiel de Buckingham à un potentiel de Lennard-Jones.
OPTIONS
Options pour spécifier les fichiers de sortie :
-o [<.xvg>] (potje.xvg)
fichier xvgr/xmgr
D'autres options:
-[maintenant (non)
Afficher la sortie .xvg, .xpm, .eps et .pdb fichiers
-xvg
formatage du tracé xvg : xmgrace, xmgr, aucun
-c6 (0.001)
C6
-cn (1e-06)
Constante de répulsion
-pouvoir (12)
Puissance du terme de répulsion
-sig (0.3)
sigma
-eps (1)
epsilon
-A (100000)
Buckingham A.
-B (32)
Buckingham B.
-C (0.001)
Buckingham C.
-qi (0)
qi
-qj (0)
qj
-sigfac (0.7)
Facteur devant sigma pour démarrer l'intrigue
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