Il s'agit de la commande idconvert qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
idconvert — Convertir les formats de fichiers d'identification de spectrométrie de masse.
SYNOPSIS
idconvert [choix] [masques de fichiers]
DESCRIPTION
Cette page de manuel documente brièvement les idconvert logiciel livré dans le outils libpwiz
emballer. Ce programme permet de convertir les données d'identification des protéines par spectrométrie de masse
fichiers d'un format à un autre.
OPTIONS
-v | --verbeux
Affichez des informations détaillées sur la progression du traitement.
-f | --filelist nom de fichier
Utilise le contenu de nom de fichier qui répertorie les noms de fichiers.
-o | --répertoire extérieur dir
Définissez le répertoire de sortie ('-' pour stdout) sur dir. Par défaut, la sortie
le répertoire est '.' (c'est-à-dire le répertoire de travail courant).
-c | --config nom de fichier
Définissez le fichier de configuration sur nom de fichier.
-e | --ext poste
Définissez l'extension des fichiers de sortie sur poste. Peut être mzid ou pepXML ou txt.
--mzIdentML
Écrire mzIdentML format (par défaut).
--pepXML Écrire pepXML le format.
--text Écrire hiérarchique texte le format.
EXEMPLES
Convertir sequest.pepXML en sequest.mzid
idconvert sequest.pepXML
Convertir mascot.mzid en mascot.pepXML
idconvert mascotte.mzid --pepXML
Utiliser un fichier de configuration
idconvert xtandem.pep.xml -c config.txt
RETOUR VALEURE
Le nombre de fichiers ayant échoué.
Utilisez idconvert en ligne en utilisant les services onworks.net
