Il s'agit de la commande kraken-mpa-report qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
kraken-mpa-report - attribution d'étiquettes taxonomiques à de courtes séquences d'ADN
SYNOPSIS
kraken-mpa-rapport [--db KRAKEN_DB_NAME] [Options] <kraken sortie fichier(s)>
OPTIONS
--db Nom
Nom de la base de données Kraken (par défaut : aucun)
--show-zéros
Afficher les taxons même s'ils n'ont pas de lecture dans un échantillon
--ligne-en-tête
Afficher une ligne d'en-tête indiquant les ID d'échantillon (les ID d'échantillon sont les noms de fichiers)
--intermédiaire-rangs
Afficher les taxons qui ne sont pas aux rangs standard avec le préfixe x__
Utilisez kraken-mpa-report en ligne en utilisant les services onworks.net