Il s'agit de la commande last-pair-probs qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
last-pair-probs - Lire les alignements de lectures d'ADN appariées sur un génome et effectuer des estimations
SYNOPSIS
dernière-paire-probations [options] alignements entrelacés
dernière-paire-probations [options] alignements1 alignements2
DESCRIPTION
Lire les alignements de lectures d'ADN appariées sur un génome et : (1) estimer la distribution de
distances entre les lectures appariées, (2) estimer la probabilité que chaque alignement
représente la source génomique de la lecture.
OPTIONS
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-r, --rna
supposer que les lectures proviennent d'ARN potentiellement épissé
-e, --estdist
il suffit d'estimer la distribution des distances
-m M, --erreur de mappage=M
n'écrivez pas d'alignements avec une probabilité d'erreur de mappage > M (par défaut : 0.01)
-f BP, --fraglen=BP
distance moyenne en pb
-s BP, --sdev=BP
écart type de distance
-d PROB, --disjoint=PROB
probabilité a priori de mappage disjoint (par défaut : 0.02 si -r, sinon 0.01)
-c CHROMÉ, --circulaire=CHROME
spécifie que le chromosome CHROM est circulaire (par défaut : chrM)
-V, --version
afficher le numéro de version du programme et quitter
Utilisez last-pair-probs en ligne avec les services onworks.net
