Il s'agit de la commande maq.pl qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
maq.pl - script d'aide pour maq
SYNOPSIS
maq.pl [Options] [...]
DESCRIPTION
script d'aide pour maq
Version: 0.4.7
OPTIONS
course facile
pipeline simple pour petit ensemble de données
demo démonstration des fonctionnalités maq (pour SE uniquement)
Filtre SNP
filtrer les SNP
carte statistique
extraire les statistiques de la sortie d'erreur de 'maq map'
chrpt2snp
convertir le fichier chr_rpt de dbSNP en fichier .snp
ucsc2snp
convertir le vidage SNP de l'UCSC en fichier .snp
fastq2bfq
convertir fastq en lot
cat2pair
convertir le format des lectures de fin appariées
sv appeler des variations structurelles
indépendant
sortie indelpe post-traitement
Utilisez maq.pl en ligne en utilisant les services onworks.net