Il s'agit de la commande mia-2dseries2sets qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mia-2dseries2sets - Combinez les images d'une série en ensembles.
SYNOPSIS
mia-2dseries2sets -o [choix]
DESCRIPTION
mia-2dseries2sets Ce programme prend tous les fichiers images qui sont donnés en paramètres libres sur
la ligne de commande et crée des ensembles de segmentation basés sur les informations trouvées dans les images.
Les informations utilisées sont l'emplacement z de la tranche et le numéro d'acquisition. Le code est
sur mesure pour utiliser les descripteurs correspondants définis dans la norme DICOM. Toutes les images avec
le même emplacement de tranche sera regroupé dans un ensemble de segmentation et ordonné
selon leur numéro d'acquisition. Les emplacements des tranches sont arrondis à une précision de trois chiffres
pour faire une comparaison appropriée des valeurs à virgule flottante faisable.
OPTIONS
-o --out-directory=(sortie, requise); chaîne de caractères
répertoire de sortie (doit exister et être accessible en écriture)
--pas de copie
ne copiez pas les fichiers image dans le répertoire de sortie
d’aide & Info
-V --verbose=avertissement
verbosité de la sortie, imprimer des messages de niveau donné et de priorités plus élevées.
Les priorités prises en charge à partir du niveau le plus bas sont :
info ‐ Messages de bas niveau
tracer ‐ Trace d'appel de fonction
échouer ‐ Signaler les échecs des tests
avertissement - Mises en garde
erreur - Signaler les erreurs
déboguer ‐ Sortie de débogage
message ‐ Messages normaux
fatal ‐ Ne signaler que les erreurs fatales
--droits d'auteur
imprimer les informations de copyright
-h --aide
imprimer cette aide
- ? --usage
imprimer une courte aide
--version
imprimer le numéro de version et quitter
En cours
--threads = -1
Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement, ce nombre doit être inférieur
ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans la machine. (-1:
estimation automatique).Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement,Ceci
doit être inférieur ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans
la machine. (-1 : estimation automatique).
PLUGINS : image 2D/io
bmp Prise en charge d'entrée/sortie d'images BMP 2D
Extensions de fichiers reconnues : .BMP, .bmp
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés
pool de données E/S virtuelle vers et depuis le pool de données interne
Extensions de fichiers reconnues : .@
dico io d'image 2D pour DICOM
Extensions de fichiers reconnues : .DCM, .dcm
Types d'éléments pris en charge :
signé 16 bits, non signé 16 bits
exr un plugin 2dimage io pour les images OpenEXR
Extensions de fichiers reconnues : .EXR, .exr
Types d'éléments pris en charge :
32 bits non signé, virgule flottante 32 bits
jpg un plugin 2dimage io pour les images jpeg en niveaux de gris
Extensions de fichiers reconnues : .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg
Types d'éléments pris en charge :
8 bits non signé
png un plugin 2dimage io pour les images png
Extensions de fichiers reconnues : .PNG, .png
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés
brut Prise en charge de la sortie d'images RAW 2D
Extensions de fichiers reconnues : .RAW, .raw
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits
tif Prise en charge d'entrée/sortie d'images TIFF 2D
Extensions de fichiers reconnues : .TIF, .TIFF, .tif, .tiff
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés, 32 bits non signés
vue un plugin 2dimage io pour les images vista
Extensions de fichiers reconnues : .V, .VISTA, .v, .vista
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits
EXEMPLE
Créez les ensembles de segmentation à partir d'une série d'images DICOM et copiez les fichiers dans le
répertoire de sortie (la copie est la valeur par défaut).
mia-2dseries2sets -o /home/user/series /net/dicoms/patient1/series1/*.dcm
Auteurs)
Gert Wollny
DROIT D'AUTEUR
Ce logiciel est protégé par copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Allemagne et Madrid, Espagne. Ça arrive
avec ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE et vous pouvez le redistribuer selon les termes du GNU
LICENCE PUBLIQUE GENERALE Version 3 (ou ultérieure). Pour plus d'informations, exécutez le programme avec le
l'option '--copyright'.
Utilisez mia-2dseries2sets en ligne à l'aide des services onworks.net