mia-3dgetslice - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

mia-3dgetslice - Extraire des tranches d'une image 3D.

SYNOPSIS

mia-3dgetslice -i -o [choix]

DESCRIPTION

mia-3dgetslice Ce programme est utilisé pour extraire des tranches 2D d'un ensemble de données 3D et les stocker
dans des fichiers séparés. Les fichiers de sortie seront numérotés en fonction de leur index de tranche.

OPTIONS

-i --in-file=(entrée, requise); io
image(s) d'entrée à filtrer Pour les types de fichiers pris en charge, voir
PLUGINS : 3dimage/io

-o --out-file=(sortie, requise); io
image(s) de sortie. Si nombre != 1 alors celui-ci est utilisé comme nom de base et doit
être donné sans extension car cela sera basé sur l'option '--type'.
Si nombre=1 alors ce nom de fichier exact sera utilisé. Pour le fichier pris en charge
types voir PLUGINS:2dimage/io

-t --type=png
type de fichier de sortie pour le nombre != 1
Appareils valeurs sommes:( pb, pool de données, dicom, exr, jpg, png, brut,
typhus, vue, )

-s --start=0
numéro de tranche de débutnuméro de tranche de début

-n --nombre=1
nombre de tranches (all=0) nombre de tranches (all=0)

--nchiffres=4
nombre minimum de chiffres des numéros de nom de fichier (si n != 1) nombre minimum
de chiffres des numéros de nom de fichier (si n != 1)

-d --dir=xy
direction de la coupe (xy=axial, xz=coronal, yz=sagittal)
xz ‐ obtenir une tranche xz (coronale)
yz ‐ obtenir une tranche yz (sagittale)
xy ‐ obtenir une tranche xy (axiale)

d’aide & Info
-V --verbose=avertissement
verbosité de la sortie, imprimer des messages de niveau donné et de priorités plus élevées.
Les priorités prises en charge à partir du niveau le plus bas sont :
info ‐ Messages de bas niveau
tracer ‐ Trace d'appel de fonction
échouer ‐ Signaler les échecs des tests
avertissement - Mises en garde
erreur - Signaler les erreurs
déboguer ‐ Sortie de débogage
message ‐ Messages normaux
fatal ‐ Ne signaler que les erreurs fatales

--droits d'auteur
imprimer les informations de copyright

-h --aide
imprimer cette aide

- ? --usage
imprimer une courte aide

--version
imprimer le numéro de version et quitter

En cours
--threads = -1
Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement, ce nombre doit être inférieur
ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans la machine. (-1:
estimation automatique).Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement,Ceci
doit être inférieur ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans
la machine. (-1 : estimation automatique).

PLUGINS : image 2D/io

bmp Prise en charge d'entrée/sortie d'images BMP 2D

Extensions de fichiers reconnues : .BMP, .bmp

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés

pool de données E/S virtuelle vers et depuis le pool de données interne

Extensions de fichiers reconnues : .@

dico io d'image 2D pour DICOM

Extensions de fichiers reconnues : .DCM, .dcm

Types d'éléments pris en charge :
signé 16 bits, non signé 16 bits

exr un plugin 2dimage io pour les images OpenEXR

Extensions de fichiers reconnues : .EXR, .exr

Types d'éléments pris en charge :
32 bits non signé, virgule flottante 32 bits

jpg un plugin 2dimage io pour les images jpeg en niveaux de gris

Extensions de fichiers reconnues : .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Types d'éléments pris en charge :
8 bits non signé

png un plugin 2dimage io pour les images png

Extensions de fichiers reconnues : .PNG, .png

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés

brut Prise en charge de la sortie d'images RAW 2D

Extensions de fichiers reconnues : .RAW, .raw

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

tif Prise en charge d'entrée/sortie d'images TIFF 2D

Extensions de fichiers reconnues : .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés, 32 bits non signés

vue un plugin 2dimage io pour les images vista

Extensions de fichiers reconnues : .V, .VISTA, .v, .vista

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

PLUGINS : image 3D/io

il analyse Analyser l'image 7.5

Extensions de fichiers reconnues : .HDR, .hdr

Types d'éléments pris en charge :
non signé 8 bits, signé 16 bits, signé 32 bits, virgule flottante 32 bits,
virgule flottante 64 bits

pool de données E/S virtuelle vers et depuis le pool de données interne

Extensions de fichiers reconnues : .@

dico Série d'images Dicom en 3D

Extensions de fichiers reconnues : .DCM, .dcm

Types d'éléments pris en charge :
signé 16 bits, non signé 16 bits

hdf5 E/S image 5D HDF3

Extensions de fichiers reconnues : .H5, .h5

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, signé 64 bits, non signé 64 bits, flottant
virgule 32 bits, virgule flottante 64 bits

Inria image INRIA

Extensions de fichiers reconnues : .INR, .inr

Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits

mhd IO d'image 3D MetaIO utilisant l'implémentation VTK (expérimental).

Extensions de fichiers reconnues : .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits

chouette E/S image 1D NIFTI-3

Extensions de fichiers reconnues : .NII, .nii

Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, 64 bits signé, 64 bits non signé, virgule flottante 32
bit, virgule flottante 64 bits

vff Format raster du soleil VFF

Extensions de fichiers reconnues : .VFF, .vff

Types d'éléments pris en charge :
non signé 8 bits, signé 16 bits

vue Vue 3D

Extensions de fichiers reconnues : .V, .VISTA, .v, .vista

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

vii Image 3D entrée et sortie VTK-XML (expérimental).

Extensions de fichiers reconnues : .VTI, .vti

Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits

vtk Entrée et sortie héritées d'images VTK 3D (expérimentales).

Extensions de fichiers reconnues : .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

EXEMPLE

Stockez 5 tranches coronales à partir de la tranche 120 coronalXXXX.png à partir de image.v.

mia-3dgetslice -i image.v -o coronale -t png -n 5 -s 120

Auteurs)

Gert Wollny

DROIT D'AUTEUR

Ce logiciel est protégé par copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Allemagne et Madrid, Espagne. Ça arrive
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LICENCE PUBLIQUE GENERALE Version 3 (ou ultérieure). Pour plus d'informations, exécutez le programme avec le
l'option '--copyright'.

Utilisez mia-3dgetslice en ligne en utilisant les services onworks.net