Il s'agit de la commande mia-3dsegment-ahmed qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mia-3dsegment-ahmed - Exécute une segmentation c-means floue d'une image 3D.
SYNOPSIS
mia-3dsegment-ahmed -i -c [choix]
DESCRIPTION
mia-3dsegment-ahmed Ce programme met en œuvre une variante de l'article : Mohamed N. Ahmed et.
al, "Un algorithme modifié de C-Means flou pour l'estimation du champ de biais et la segmentation de l'IRM
Data", IEEE Trans. on Medical Imaging, Vol. 21, No. 3, March 2002, les modifications sont : p=2 et
exp
OPTIONS
Fichier-IO
-i --in-file=(entrée, requise); io
image à segmenter Pour les types de fichiers pris en charge, voir PLUGINS:3dimage/io
-c --class-file=(sortie, requise); io
images de probabilité de classe, le type d'image doit prendre en charge plusieurs images et
valeurs à virgule flottante Pour les types de fichiers pris en charge, voir PLUGINS:3dimage/io
-b --out-file=(sortie); io
L'image corrigée du biais sera du même type que l'image d'entrée. Si ce
n'est pas donné, la correction de biais ne sera pas appliquée. Pour
types de fichiers pris en charge voir PLUGINS:3dimage/io
d’aide & Info
-V --verbose=avertissement
verbosité de la sortie, imprimer des messages de niveau donné et de priorités plus élevées.
Les priorités prises en charge à partir du niveau le plus bas sont :
info ‐ Messages de bas niveau
tracer ‐ Trace d'appel de fonction
échouer ‐ Signaler les échecs des tests
avertissement - Mises en garde
erreur - Signaler les erreurs
déboguer ‐ Sortie de débogage
message ‐ Messages normaux
fatal ‐ Ne signaler que les erreurs fatales
--droits d'auteur
imprimer les informations de copyright
-h --aide
imprimer cette aide
- ? --usage
imprimer une courte aide
--version
imprimer le numéro de version et quitter
Paramètres
-n --no-de-classes=3
nombre de classes nombre de classes
-C --class-centres=
centres de classe initiaux, ce paramètre remplace 'no-of-classes'.
-s --spread=64
paramètre de propagation décrivant la force de distinction mattarspread
paramètre décrivant la force de distinction mattar
En cours
--threads = -1
Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement, ce nombre doit être inférieur
ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans la machine. (-1:
estimation automatique).Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement,Ceci
doit être inférieur ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans
la machine. (-1 : estimation automatique).
PLUGINS : image 3D/io
il analyse Analyser l'image 7.5
Extensions de fichiers reconnues : .HDR, .hdr
Types d'éléments pris en charge :
non signé 8 bits, signé 16 bits, signé 32 bits, virgule flottante 32 bits,
virgule flottante 64 bits
pool de données E/S virtuelle vers et depuis le pool de données interne
Extensions de fichiers reconnues : .@
dico Série d'images Dicom en 3D
Extensions de fichiers reconnues : .DCM, .dcm
Types d'éléments pris en charge :
signé 16 bits, non signé 16 bits
hdf5 E/S image 5D HDF3
Extensions de fichiers reconnues : .H5, .h5
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, signé 64 bits, non signé 64 bits, flottant
virgule 32 bits, virgule flottante 64 bits
Inria image INRIA
Extensions de fichiers reconnues : .INR, .inr
Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits
mhd IO d'image 3D MetaIO utilisant l'implémentation VTK (expérimental).
Extensions de fichiers reconnues : .MHA, .MHD, .mha, .mhd
Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits
chouette E/S image 1D NIFTI-3
Extensions de fichiers reconnues : .NII, .nii
Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, 64 bits signé, 64 bits non signé, virgule flottante 32
bit, virgule flottante 64 bits
vff Format raster du soleil VFF
Extensions de fichiers reconnues : .VFF, .vff
Types d'éléments pris en charge :
non signé 8 bits, signé 16 bits
vue Vue 3D
Extensions de fichiers reconnues : .V, .VISTA, .v, .vista
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits
vii Image 3D entrée et sortie VTK-XML (expérimental).
Extensions de fichiers reconnues : .VTI, .vti
Types d'éléments pris en charge :
signé 8 bits, non signé 8 bits, signé 16 bits, non signé 16 bits, signé 32
bit, 32 bits non signé, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64 bits
vtk Entrée et sortie héritées d'images VTK 3D (expérimentales).
Extensions de fichiers reconnues : .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits
EXEMPLE
Exécutez une segmentation à 5 classes sur l'image d'entrée input.v et stockez les images de probabilité de classe
dans cls.v.
mia-3dsegment-ahmed -i input.v -a 5 -o cls.v
Auteurs)
Gert Wollny
DROIT D'AUTEUR
Ce logiciel est protégé par copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Allemagne et Madrid, Espagne. Ça arrive
avec ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE et vous pouvez le redistribuer selon les termes du GNU
LICENCE PUBLIQUE GENERALE Version 3 (ou ultérieure). Pour plus d'informations, exécutez le programme avec le
l'option '--copyright'.
Utiliser mia-3dsegment-ahmed en ligne en utilisant les services onworks.net
