Il s'agit de la commande minccmp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
minccmp - compare un ou plusieurs fichiers minc à l'aide d'opérateurs de comparaison
SYNOPSIS
minccmp [ ] [ ...]
DESCRIPTION
minccmp calculera des mesures statistiques simples entre deux fichiers minc ou plus en
comparer tous les fichiers suivants au premier. Les résultats pour chaque fichier suivant sont alors
retourné dans l'ordre. Par défaut, toutes les statistiques sont calculées. Si des statistiques spécifiques sont
demandée via une option de ligne de commande, alors seules les statistiques demandées sont imprimées.
Une fonctionnalité très utile de ce programme est la possibilité de restreindre l'ensemble des voxels
inclus dans le calcul statistique, soit en restreignant la plage des valeurs incluses
(-floor, -ceil ou -range), ou en utilisant un fichier de masque (-mask) avec une plage restreinte.
Les statistiques de comparaison disponibles dans minccmp sont données ci-dessous. A noter que deux de ces
(-xcorr et -zscore) sont une approximation très proche de ce qui est utilisé dans minctracc.
OPTIONS
Notez que les options peuvent être spécifiées sous forme abrégée (tant qu'elles sont uniques) et
peut être donné n'importe où sur la ligne de commande.
Général Options
-tabasser
Écraser un fichier existant.
-noclobber
N'écrase pas un fichier existant (par défaut).
-déboguer Videz beaucoup d'informations supplémentaires (pour quand les choses se détraquent).
-verbeux
Imprimez des informations supplémentaires (plus que la valeur par défaut).
-silencieux Imprimez uniquement les numéros demandés
-max_buffer_size_in_ko taille
Spécifiez la taille maximale des tampons internes (en kilo-octets). La valeur par défaut est 4 Mo.
-check_dimensions
Vérifiez que tous les fichiers d'entrée ont un échantillonnage correspondant dans les dimensions mondiales (par défaut).
-nocheck_dimensions
Ignorez toutes les différences dans l'échantillonnage des dimensions mondiales pour les fichiers d'entrée.
Volume gamme Options
-sol m.
Limite inférieure des plages de données à inclure dans les calculs statistiques.
-plafond max
Limite supérieure des plages de données à inclure dans les calculs statistiques.
-gamme m.,max
Limite inférieure et supérieure des plages de données à inclure dans les statistiques.
-masque nom de fichier.mnc
Nom du fichier à utiliser pour masquer les données incluses dans les calculs statistiques.
Basic statistiques
-tout Calculer toutes les mesures statistiques. C'est la valeur par défaut.
-ssq Imprimer la différence de somme au carré entre deux fichiers d'entrée
SSQ = Somme( (AB)^2 )
-rmse Imprimer l'erreur quadratique moyenne entre deux fichiers d'entrée
RMSE = sqrt( 1/n * Somme((AB)^2))
-xcorr Imprimer la corrélation croisée entre deux fichiers d'entrée
XCORR = Somme((A*B)^2) / (sqrt(Somme(A^2)) * sqrt(Somme(B^2))
-zscore
Imprimer la différence de score z entre deux fichiers d'entrée
ZSCORE = Somme( |((A - moyenne(A)) / stdev(A)) -
((B - moyenne(B)) / stdev(B))| ) / n
-similarité
Calculer la matrice de confusion, en supposant que les valeurs de volume représentent un
classe discrète de valeurs possibles. La valeur maximale de l'étiquette est actuellement limitée à
dix (10). Imprime la statistique de similarité des dés ainsi que la spécificité, la sensibilité,
précision et kappa pour chaque classe et pour les volumes globaux.
Générique Options en TOUTE commandes:
-Aide Imprimez le résumé des options de la ligne de commande et quittez.
-version
Imprimez le numéro de version du programme et quittez.
Utilisez minccmp en ligne en utilisant les services onworks.net
