mincmath - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

mincmath - effectuer des opérations mathématiques simples sur les fichiers minc

SYNOPSIS

mincmath [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

DESCRIPTION

Mincmath effectuera des opérations mathématiques simples, voxel par voxel, sur un ou plusieurs fichiers minc de
la même forme et ayant le même échantillonnage de coordonnées, produisant un seul fichier de sortie.
Les opérations peuvent être unaires (opérer sur un fichier), binaires (deux fichiers d'entrée) ou cumulatives
(fonctionne sur deux ou plusieurs fichiers d'entrée). Les opérations cumulatives peuvent également être effectuées sur un
dimension spécifiée des fichiers d'entrée.

OPTIONS

Notez que les options peuvent être spécifiées sous forme abrégée (tant qu'elles sont uniques) et
peut être donné n'importe où sur la ligne de commande.

Général Options

-2 Créez un fichier de sortie au format MINC 2.0.

-tabasser
Écraser un fichier existant.

-noclobber
N'écrase pas un fichier existant (par défaut).

-no_clobber
synonyme de -noclobber.

-verbeux
Imprimez les informations de progression pour chaque bloc de données copié (par défaut).

-silencieux N'imprimez pas les informations de progression.

-déboguer Imprimez les informations de débogage.

-liste de fichiers nom de fichier
Spécifiez un fichier contenant une liste de noms de fichiers d'entrée. Si "-" est donné, alors le fichier
les noms sont lus à partir de l'entrée standard. Si cette option est donnée, alors il devrait
qu'aucun nom de fichier d'entrée ne soit spécifié sur la ligne de commande. Lignes vides dans le fichier d'entrée
sont ignorés.

-copie_en-tête
Copiez toutes les informations d'en-tête du premier fichier d'entrée (par défaut pour une entrée
fichier).

-nocopy_header
Ne copiez pas tout l'en-tête du premier fichier d'entrée ; copier uniquement les coordonnées
informations (par défaut pour plus d'un fichier d'entrée).

-Type de fichier
Créez un fichier de sortie avec le même type que le premier fichier d'entrée (par défaut).

-octet Stockez les voxels de sortie au format entier 8 bits.

-court Stockez les voxels de sortie au format entier 16 bits.

-int Stockez les voxels de sortie au format entier 32 bits.

-longue Remplacé par -int.

-flotter Stockez les voxels de sortie au format à virgule flottante 32 bits.

-double
Stockez les voxels de sortie au format à virgule flottante 64 bits.

-signé
Utilisez le format d'entier en complément à deux signé. S'applique uniquement si le type de voxel de sortie
est spécifié comme étant un type entier (l'un des -octet, -court, -int or -longue).

-non signé
Utilisez le format d'entier non signé. S'applique uniquement si le type de voxel de sortie est spécifié sur
être un type entier (l'un des -octet, -court, -int or -longue).

-gamme m. max
Restreindre la plage valide de données entières. S'applique uniquement si l'un des -octet,
-court, -int or -longue options est spécifié.

-max_buffer_size_in_ko taille
Spécifiez la taille maximale des tampons internes (en kilo-octets). La valeur par défaut est 4096
(4MB).

-dimension nom dim
Spécifiez une dimension le long de laquelle nous souhaitons effectuer une opération cumulative.

-check_dimensions
Vérifiez que tous les fichiers d'entrée ont un échantillonnage correspondant dans les dimensions mondiales (par défaut).

-nocheck_dimensions
Ignorez toutes les différences dans l'échantillonnage des dimensions mondiales pour les fichiers d'entrée.

-propagate_nan
Les données non valides (Not-A-Number ou NaN) à un voxel dans l'un des fichiers d'entrée seront
produire des données invalides dans le fichier de sortie à ce voxel (par défaut).

-ignorer_nan
Pour les opérations cumulatives, les données invalides (NaN) dans un fichier d'entrée sont ignorées, c'est-à-dire.
traité comme s'il n'était pas présent.

- nan Lorsqu'une opération illégale est tentée sur un voxel (comme diviser par zéro), invalide
les données (NaN) sont stockées dans le fichier de sortie (par défaut). N'ayant aucune donnée d'entrée valide pour un
l'opération cumulative est également considérée comme une opération illégale lorsque -ignorer_nan is
utilisé.

-zéro Lorsqu'une opération illégale est tentée sur un voxel (comme diviser par zéro), la valeur
zéro est stocké dans le fichier de sortie.

-valeur_illégal Plus-value
Lorsqu'une opération illégale est tentée sur un voxel (comme une division par zéro), le
la valeur spécifiée est stockée dans le fichier de sortie.

Options en en précisant des constantes

-constante Plus-value
Spécifiez une seule constante.

-const Plus-value
synonyme de -constante.

-const2 value1 value2
Spécifiez deux constantes.

Opérations

-ajouter Ajoutez cumulativement deux volumes ou plus, ou ajoutez un volume et une constante.

-sous Soustraire deux volumes ou un volume moins une constante.

-multi Multipliez cumulativement deux volumes ou plus, ou multipliez un volume et une constante.

-div Divisez deux volumes ou un volume divisé par une constante.

-inverser
Calculez 1/x à chaque voxel, où x est la valeur de voxel d'entrée. Si une constante c est
spécifié (avec -constant), puis calculez c/x à chaque voxel.

-sqrt Calculer la racine carrée d'un volume.

-carré
Calculer le carré d'un volume.

-abdos Calculer la valeur absolue d'un volume.

-maximum
Calculer le maximum d'une série de volumes.

-le minimum
Calculer le minimum d'une série de volumes.

-exp Calculer c2*exp(c1*x) à chaque voxel d'un volume, où x est la valeur du voxel et c1
ainsi que c2 sont des constantes spécifiées par -constante c1 or -const2 c1 c2. La valeur par défaut
pour ces constantes est de 1.0.

-Journal Calculer journal(x/c2)/c1 pour chaque voxel d'un volume, où x est la valeur du voxel et
c1 ainsi que c2 sont des constantes spécifiées par -constante c1 or -const2 c1 c2. Le défaut
la valeur de ces constantes est de 1.0.

-échelle Mettre un volume à l'échelle soit en le multipliant par une seule constante (utiliser -constante) ou par
en multipliant par la première constante et en ajoutant la seconde (utilisez -const2).

-serrer Fixez un volume pour qu'il se situe entre deux valeurs spécifiées avec -const2.

-segment
Segmentez (binarisez) un volume de sorte que les valeurs comprises dans la plage spécifiée par -const2
donner la valeur 1 et ceux en dehors donnent la valeur 0.

-segment
Le contraire de -segment: valeurs comprises dans la plage spécifiée par -const2 donner la valeur 0 et
ceux en dehors donnent la valeur 1.

-pourcentage diff
Calculez la différence en pourcentage entre deux volumes (normalisée au premier
le volume). Si le premier volume est inférieur à un seuil (ou zéro), alors la valeur
spécifié par - nan or -zéro est utilisé. Le seuil est spécifié à l'aide -constante,
avec une valeur par défaut de zéro.

-pd synonyme de -pourcentage diff.

-eq Testez l'égalité de deux volumes ou d'un volume et d'une constante. Les valeurs sont arrondies à
l'entier le plus proche avant d'effectuer le test. Sortie 1 pour vrai et 0 pour faux
à chaque voxel.

-Ne Testez l'inégalité de deux volumes ou d'un volume et d'une constante. Les valeurs sont arrondies
à l'entier le plus proche avant d'effectuer le test. Sortie 1 pour vrai et 0 pour
faux à chaque voxel.

-Gt Testez le volume 1 > le volume 2 ou un volume > une constante. Sortie 1 pour vrai et 0 pour
faux à chaque voxel.

-donner Testez le volume 1 >= le volume 2 ou un volume >= une constante. Sortie 1 pour vrai et 0
pour faux à chaque voxel.

-lt Testez le volume 1 < volume 2 ou un volume < une constante. Sortie 1 pour vrai et 0 pour
faux à chaque voxel.

-Le Testez pour le volume 1 <= volume 2 ou un volume <= une constante. Sortie 1 pour vrai et 0
pour faux à chaque voxel.

-et Testez le volume 1 && le volume 2 ou un volume && une constante. Les valeurs sont arrondies au
entier le plus proche avant d'effectuer le test. Sortie 1 pour vrai et 0 pour faux à
chaque voxel.

Ou Essai pour le tome 1 || tome 2 ou un tome || une constante. Les valeurs sont arrondies au
entier le plus proche avant d'effectuer le test. Sortie 1 pour vrai et 0 pour faux à
chaque voxel.

-ne pas Effectuez une négation logique sur un volume : convertissez non zéro en zéro et zéro en un.
Les valeurs sont arrondies à l'entier le plus proche avant la négation.

-isnan Testez un volume pour les valeurs invalides (NaN). Sortie 1 pour les valeurs invalides et 0 pour les valeurs valides
valeurs.

-nisnan
En face de -isnan. Sortie 0 pour les valeurs invalides et 1 pour les valeurs valides.

-count_valid
Comptez le nombre de voxels valides sur une série de volumes. Si aucun des volumes
a des données valides, alors zéro est écrit (c'est-à-dire. -zéro ainsi que -ignorer_nan sont toujours
supposée, contrairement à d'autres opérations cumulatives).

Générique Options en TOUTE commandes:

-Aide Imprimez le résumé des options de la ligne de commande et quittez.

-version
Imprimez le numéro de version du programme et quittez.

Utilisez mincmath en ligne en utilisant les services onworks.net